40001016066P4 Programa de Pós-Graduação em Bioinformática: Recent submissions
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Integração multiômica por análise fatorial revela mecanismos da heterogeneidade da doença de Alzheimer
(2025)Resumo: Os correlatos moleculares da doença de Alzheimer (DA) vêm sendo cada vez mais definidos por abordagens ômicas. No entanto, os resultados obtidos de diferentes tipos de dados ou coortes costumam ser difíceis de ... -
Mapeando "hypes" : exageros e esperanças na medicina
(2025)Resumo: A inovação médica é frequentemente acompanhada por ciclos de otimismo e ceticismo, comumente expressos em inglês através do par retórico "hype or hope". Embora ampla mente utilizado como marcador de hesitação ... -
Incorporação de texto baseada em projeção aleatória inspirada em bioinformática
(2026)Resumo: Este estudo apresenta o SWeePtex, uma metodologia para a geração de incorpora ções vetoriais de texto (text embeddings) por meio de projeção aleatória, inspirada em técnicas de Bioinformática. A abordagem permite ... -
SWeeP e estudos de projeção randômica aplicados à problemas da bioinformática
(2025)Resumo: Diversos problemas da bioinformática envolvem dados de alta dimensionalidade. Dentre as soluções para lidar com grande volume de dados está a redução de dimensionalidade, que pode ser obtida pelo uso da projeção ... -
Ferramentas de inteligência artificial para aplicação em filogenia e em Grafo de Lattice
(2024)Resumo: Esta dissertação apresenta as ferramentas rSWeeP e R3TO como inovações no campo da bioinformática e otimização de redes. O rSWeeP é uma implementação em R do método SWeeP, desenvolvida para popularizar esta metodologia ... -
Assinatura molecular de citocinas na doença de alzheimer e associações clínicas nas coortes ROSMAP, Mayo e MSBB
(2025)Resumo: A doença de Alzheimer (DA) é uma doença neurodegenerativa complexa associada à neuroinflamação crônica. Este estudo investigou o perfil de expressão de citocinas em amostras do córtex cerebral de indivíduos idosos ... -
Identificação de variantes de splicing alternativo suscetíveis a degradação pela via NMD por uma abordagem de bioinformática
(2020)Resumo: A estatística mais recente do GENCODE para a espécie humana, identificou 19.965 genes codificadores de proteína e um número de transcritos oriundos destes genes superior a 83.000. Esse fato está associado principalmente ... -
Sweepweb : explorando a comparação de sequências biológicas em escala de bigdata
(2020)Resumo: Novas tecnologias de sequenciamento permitem a geração de grandes quantidades de dados das ômicas e traz o desafio de tornar a análise desses dados possível. Os algoritmos baseados em alinhamento foram projetados ... -
Biopen : ferramenta computacional para coleta e análise de dados laboratoriais de enteropatógenos
(2011)Resumo: A presente pesquisa propõe o desenvolvimento da ferramenta computacional chamada BIOPEN, na área biológica para coletar, armazenar e gerar informações sobre características de Enteropatógenos bacterianos obtidas ... -
Neuritescan : um pacote R para análise de neuritos
(2021)Resumo: Para compreender doenças neurológicas é imprescindível analisar a morfologia e as funções dos neurônios. As funções neuronais são diretamente ligadas às conexões entre os neurônios. Estas conexões ocorrem nos ... -
BOX.BIO.BR an integrative bioinformatics resource platform
(2015)Resumo: Na prática da Bioinformática é natural que existam três tipos de pesquisadores envolvidos, o especialista em Biologia, o especialista em Informática e o pesquisador híbrido, com conhecimentos avançados nas duas ... -
Identificação in silico de sítios de ligação à proteína regulatória NTRC em sequências genômicas
(2019)Resumo: O nitrogênio é um elemento essencial para a manutenção da vida na Terra. Apesar disso sua maior concentração está presente na atmosfera. Algumas proteobactérias possuem o sistema Ntr, que é responsável pelo processo ... -
PreProcSEQ : pipeline de controle de qualidade e pré-processamento de dados de RNA-Seq
(2022)Resumo: O sequenciamento de RNA através de sequenciadores de nova geração é denominado de RNA-Se , este sequenciamento permite estimar a abundância de transcritos e a identificação de genes diferencialmente expressos entre ... -
Quando há muito o que ser dito : utilização de técnicas de inteligência artificial e análise de sentimentos para classificação de textos relacionados ao suicídio
(2022)Resumo: Segundo dados da Organização Mundial da Saúde, anualmente, mais de 700 mil pessoas morrem por suicídio no mundo. Nesse contexto, buscou-se no presente artigo utilizar-se das técnicas de inteligência artificial e ... -
Análise da incompletude na inferência estatística : uma aplicação em dados clínicos
(2017)Resumo: Lacunas são comuns a pesquisa empírica, em especial na área da saúde, onde a falta de dados é muitas vezes um fator inevitável devido à logística da captação de informações. Essa incompletude é danosa à análise de ... -
Montagem, anotação e comparação do genoma parcial da bactéria Azoarcus olearius DQS4
(2015)Resumo: Existem na natureza bactérias capazes de transformar o nitrogênio existente no ar em amônia, um processo denominado Fixação Biológica de Nitrogênio (FBN), e transferi-lá para plantas nessa forma a qual consigam ... -
Tacos : avaliação de árvores filogenéticas
(2021)Resumo: O estudo das relações entre sequências genéticas auxiliam diversas áreas biológicas. A filogenia pode ajudar a entender histórias e processos evolutivos, como estudo das migrações e dinâmica social. A filogenia ... -
Desenvolvimento de ferramenta computacional para identificação de promotores Sigma 54 utilizando rede neural artificial
(2012)Resumo: A transcrição de vários genes bacterianos é regulada por fatores sigma alternativos da RNA polimerase como o sigma 54 ou sigma N. A sequência consenso (mrNrYTGGCACG-N4-TTGCWNNw) do fator sigma 54 esta localizada ... -
Web GAAT : a web tool for genome analysis and annotation
(2017)Resumo: A grande quantidade de dados genômicos, obtidos através de sequenciadores automáticos de DNA de nova geração, os NGS, tem possibilitado o estudo de genomas em níveis inéditos. Embora existam diferentes programas ...