40001016066P4 Programa de Pós-Graduação em Bioinformática: Recent submissions
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Identificação e avaliação de padrões repetitivos no proteoma de Trypanosoma Cruzi
(2019)Resumo: Regiões repetidas são primordiais para a sobrevivência de Trypanossoma cruzi, pois tem sido atribuído a elas um papel importante no processo de evasão do sistema imune de hospedeiros mamíferos. A compreensão de ... -
Perfis de atividade de regulon : inferência e aplicações
(2019)Resumo: O entendimento do câncer é um dos desafios cruciais da ciência atual. Em busca desta compreensão, governos e institutos em todo o mundo estão gerando uma abundância de dados biológicos. Dentre os tipos de dados, ... -
Análise filogenética da região codificante do genoma plastidial : uma abordagem livre de alinhamento utilizando o algoritmo SVect
(2018)Resumo: Com o advento do sequenciamento massivo paralelo de DNA, o campo da bioinformática tornou-se desafiador no que diz respeito a análises genômicas envolvendo Big Data. A filogenômica possui duas principais abordagens ... -
Reder Gallery : um portal para publicações de estudos de caso
(2018)Resumo: Redes complexas se tornaram uma importante ferramenta no que se refere à análise e observação de uma grande quantidade de dados e como eles interagem entre si. Por vezes, essa mesma grande quantidade de dados acaba ... -
Análise filogenética do sistema de dois componentes NtrY/NtrX em bactérias
(2018)Resumo: As bactérias conseguem viver e se adaptar em diferentes tipos de ambientes; essa característica é essencial para o sucesso da espécie. O mecanismo capaz de perceber e responder os mais diferentes estímulos do meio ... -
Análise comparativa de genomas de isolados clínicos e ambientais do gênero Herbaspirillum
(2018)Resumo: Bactérias do gênero Herbaspirillum, de origem ambiental, têm, recentemente, sido isoladas de amostras clínicas, em especial de pacientes imunocomprometidos. Para investigar como bactérias ambientais sobrevivem e ... -
RedeR Web : uma plataforma web para organização e análise de redes modulares
(2017)Resumo: A visualização de grafos ou redes tem como principal objetivo auxiliar o processo de análise e compreensão de conjuntos de dados complexos, proporcionando perspectivas diferenciadas da mesma informação, potencializando ... -
Análise metagenômica de comunidades microbianas de solos do Paraná baseada no gene 16S rRNA
(2018)Resumo: Metagenômica é o estudo das comunidades microbiológicas encontradas em um ambiente, combinando técnicas de extração de material genético, genômica e bioinformática. Através deste estudo, podemos acessar um microbioma ... -
Análise da expressão gênica em um modelo de rede de estabilidade genômica em câncer colorretal e doenças associadas
(2016)Resumo: A perda da estabilidade genômica aliada a degradação das estruturas gênicas é um dos vários aspectos importantes na evolução do câncer. Os mecanismos celulares de manutenção e estabilidade do genoma são responsáveis ... -
RNAs não codificadores regulatórios em bactérias do gênero Aeromonas
(2017)Resumo: Bactérias do gênero Aeromonas são Gram-negativas com forma de bastonetes e que não formam esporos. São anaeróbias facultativas e quimiorganotróficas. Desde 1992 formam a nova família Aeromonadaceae, ordem Aeromonadales, ... -
Análise comparativa das ferramentas de predição de ilhas genômicas
(2017)Resumo: Ilhas genômicas são segmentos de DNA em organismos procariotos, que apresentam características que diferem das demais regiões do genoma. As principais características são: conteúdo GC% distinto do genoma; presença ... -
Análise de sequências de DNA metagenômico de solos da Floresta Atlântica paranaense : implicações ecológicas e biotecnológicas
(2017)Resumo: A Floresta Atlântica Paranaense é um dos 25 hotspots de biodiversidade do mundo, sendo conhecida por sua grande diversidade de fauna e flora. Mas pouco se sabe sobre a diversidade microbiana de seu solo. A Metagenômica ... -
Montagem e anotação do genoma da bactéria endofítica diazotrófica Herbaspirillum rubrisubalbicans M4
(2016)Resumo: Herbaspirillum rubrisubalbicans M4 é uma bactéria endofítica diazotrófica que provoca a doença da estria mosqueada em algumas variedades de cana-de-açúcar e sorgo. No presente estudo, um total de 4.101.514 reads ... -
RTNduals : ferramenta para análise de co-regulação entre regulons e inferência de dual regulons
(2017)Resumo: A regulação de expressão gênica é um fator chave nos processos biológicos e composta de uma extensa cascata de eventos que envolvem diversas moléculas e elementos. Entre estes elementos podemos destacar importantes ... -
Representações vetoriais de proteomas : um estudo de caso com sequências mitocondriais
(2017)Resumo: Grande parte dos estudos evolutivos para inferir ancestralidade são conduzidos utilizando apenas alguns genes mitocondriais. Filogenias baseadas em um único gene podem não conter informações suficientes para construir ... -
Sila Eukaryotic : ferramenta para anotação automática de genes eucariotos
(2016)Resumo: A marcação e anotação de genomas são processos essenciais e fundamentais presentes na Bioinformática, necessários para a análise de sequências de DNA. Geralmente essas atividades exigem muito tempo de processamento ... -
Consolidação e validação da ferramenta Rapid Alignment Free Tool for Sequences Similarity Search to Groups (RAFTS3GROUPS) : um software rápido de clusterização para big data e buscador consistente de proteínas ortólogas
(2016)Resumo: Uma das principais análises envolvendo sequências biológicas, imprescindíveis e complexas, é a análise de homologia. A necessidade de desenvolver técnicas e ferramentas computacionais que consigam predizer com mais ... -
JMSA : Java Mass Spectrometry Analyzer: ferramenta para gerenciamento e análise de banco de espectros de massa para identificação de microrganismos
(2017)Resumo: A utilização da espectrometria de massa MALDI-TOF permite a identificação de microrganismos através da geração de espectros de massa, representando um perfil característico de sinais obtidos a partir de peptídeos ... -
Sequenciamento e análise do genoma de derxia lacustris HL 12
(2016)Resumo: As rizobactérias são bactérias de vida livre que habitam as raízes das plantas, desenvolvem uma relação de simbiose e geram benefícios aos organismos vegetais. A existência desses organismos é de grande importância ... -
Desenvolvimento e validação de sistema de apoio à decisão em urinálise com inteligência artificial utilizando redes neuronais
(2011)Resumo: A urinálise contempla uma avaliação semi-quantitativa de analitos e contagem diferencial de células presentes na urina. A análise fornece informações diagnósticas relevantes principalmente sobre o sistema urinário ...