Navegação 40001016066P4 Programa de Pós-Graduação em Bioinformática por título
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Análise comparativa das ferramentas de predição de ilhas genômicas
(2017)Resumo: Ilhas genômicas são segmentos de DNA em organismos procariotos, que apresentam características que diferem das demais regiões do genoma. As principais características são: conteúdo GC% distinto do genoma; presença ... -
Análise comparativa de genomas de isolados clínicos e ambientais do gênero Herbaspirillum
(2018)Resumo: Bactérias do gênero Herbaspirillum, de origem ambiental, têm, recentemente, sido isoladas de amostras clínicas, em especial de pacientes imunocomprometidos. Para investigar como bactérias ambientais sobrevivem e ... -
Análise da expressão gênica em um modelo de rede de estabilidade genômica em câncer colorretal e doenças associadas
(2016)Resumo: A perda da estabilidade genômica aliada a degradação das estruturas gênicas é um dos vários aspectos importantes na evolução do câncer. Os mecanismos celulares de manutenção e estabilidade do genoma são responsáveis ... -
Análise da incompletude na inferência estatística : uma aplicação em dados clínicos
(2017)Resumo: Lacunas são comuns a pesquisa empírica, em especial na área da saúde, onde a falta de dados é muitas vezes um fator inevitável devido à logística da captação de informações. Essa incompletude é danosa à análise de ... -
Análise de ilhas genômicas a partir de clusterização de proteínas
(2021)Resumo: A resistência antimicrobiana e reconhecida como uma das mais graves ameaças globais para a saúde humana no século 21. Um importante mecanismo na adaptação de microrganismos esta presente nas Ilhas Genômicas (GIs). ... -
Análise de interatomas centrados no receptor FGFR2 : potenciais alvos terapêuticos na câncer de mama
(2018)Resumo: Em doenças heterogêneas, como o câncer de mama, muitos são os fatores que adicionam pontos de fragilidade que contribuem para o inicio e a progressão do tumor. Segundo estudos de associação de genomas (GWAS), uma ... -
Análise de sequências de DNA metagenômico de solos da Floresta Atlântica paranaense : implicações ecológicas e biotecnológicas
(2017)Resumo: A Floresta Atlântica Paranaense é um dos 25 hotspots de biodiversidade do mundo, sendo conhecida por sua grande diversidade de fauna e flora. Mas pouco se sabe sobre a diversidade microbiana de seu solo. A Metagenômica ... -
Análise e caracterização de grandes grupos de proteínas utilizando técnicas de mineração de dados
(2019)Resumo: Nas últimas décadas com o rápido desenvolvimento de disciplinas como a genômica e a proteômica, a quantidade de informação biológica que é produzida e armazenada diariamente nos Bancos de Dados de proteínas tem ... -
Análise filogenética da região codificante do genoma plastidial : uma abordagem livre de alinhamento utilizando o algoritmo SVect
(2018)Resumo: Com o advento do sequenciamento massivo paralelo de DNA, o campo da bioinformática tornou-se desafiador no que diz respeito a análises genômicas envolvendo Big Data. A filogenômica possui duas principais abordagens ... -
Análise filogenética do sistema de dois componentes NtrY/NtrX em bactérias
(2018)Resumo: As bactérias conseguem viver e se adaptar em diferentes tipos de ambientes; essa característica é essencial para o sucesso da espécie. O mecanismo capaz de perceber e responder os mais diferentes estímulos do meio ... -
Análise in silico de sequências de DNA de regiões genômicas associadas ao sistema CRISPR
(2019)Resumo: As repetições palindrômicas curtas, interespaçadas e regularmente agrupadas - CRISPR - formam um sistema de imunidade adquirida em bactérias e arqueas. O CRISPR é um dos sistemas mais estudados na última década, ... -
Análise metagenômica de comunidades microbianas de solos do Paraná baseada no gene 16S rRNA
(2018)Resumo: Metagenômica é o estudo das comunidades microbiológicas encontradas em um ambiente, combinando técnicas de extração de material genético, genômica e bioinformática. Através deste estudo, podemos acessar um microbioma ... -
Avaliação quantitativa de sistemas preditores de função de proteinas
(2013-05-21)Resumo: Este trabalho propõe aprofundar as avaliações dos sistemas preditores de função de proteína que utilizam como dado de entrada a sequência de uma proteína, podendo na sua conclusão determinar qual a melhor estratégia ... -
Banco de dados biológico no modelo relacional para mineração de dados em genomas completos de procariotos disponibilizados pelo NCBI GenBank
(2012-04-09)Resumo: O NCBI GenBank, um dos três principais bancos de dados primários, tem centralizado as informações obtidas pelos processos de sequenciamento de DNA e/ou RNA e as tem distribuído no formato de arquivos textos. Nos ... -
Bioinformática aplicada à unificação dos bancos de histocompatibilidade dos laboratórios de imunogenética do Hospital de Clínicas e Genética Molecular Humana da UFPR
(2012-04-09)Resumo: O Laboratório de Imunogenética do Hospital das Clínicas (LIHC) da Universidade Federal do Paraná (UFPR) dispõe de um grande volume de dados de tipagens HLA de familiares de pacientes, que foram cadastrados em um ... -
Biopen : ferramenta computacional para coleta e análise de dados laboratoriais de enteropatógenos
(2011)Resumo: A presente pesquisa propõe o desenvolvimento da ferramenta computacional chamada BIOPEN, na área biológica para coletar, armazenar e gerar informações sobre características de Enteropatógenos bacterianos obtidas ... -
BioSom
(2013-09-11)Resumo: Genes e proteínas são de grande importância biológica para a compreensão de processos bioquímicos e requerem nomes consistentes. Existem diversas diretrizes para nomenclatura de genes, mas elas não são rigorosamente ... -
Biotex : mineração de textos inspirada em técnicas de bioinformática
(2020)Resumo: A mineração de textos trata da obtenção de informação a partir do processamento de dados não estruturados, escritos em linguagem natural. A grande quantidade de conteúdo textual digitalizado disponível através da ... -
BOX.BIO.BR an integrative bioinformatics resource platform
(2015)Resumo: Na prática da Bioinformática é natural que existam três tipos de pesquisadores envolvidos, o especialista em Biologia, o especialista em Informática e o pesquisador híbrido, com conhecimentos avançados nas duas ... -
Consolidação e validação da ferramenta Rapid Alignment Free Tool for Sequences Similarity Search to Groups (RAFTS3GROUPS) : um software rápido de clusterização para big data e buscador consistente de proteínas ortólogas
(2016)Resumo: Uma das principais análises envolvendo sequências biológicas, imprescindíveis e complexas, é a análise de homologia. A necessidade de desenvolver técnicas e ferramentas computacionais que consigam predizer com mais ...