40001016066P4 Programa de Pós-Graduação em Bioinformática: Recent submissions
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Estudo da aplicação de redes neuronais artificiais para apoio à decisão na liberação do perfil lipídico e de glicemia em jejum.
(2011)Resumo: As determinações do perfil lipídico (colesterol total, HDL-colesterol, LDL-colesterol, triglicérides) e da glicemia em jejum são ensaios de grande demanda nos laboratórios clínicos. A liberação destes resultados ... -
RedIBio - Uma ferramenta para visualização de Redes de Interações Biológicas
(2017)Resumo: A representação gráfica de dados biológicos é considerada uma problemática crescente no âmbito da pesquisa, pois a quantidade de informações a se interpretar aumenta em um ritmo acelerado. Neste cenário, o ... -
Metodologia computacional para estudo de genes com vizinhaça conectada : análise do cluster nif
(2015)Resumo: A atividade da nitrogenase é vital para a manutenção da vida terrestre e fonte de conhecimento para diversos campos científicos. Mineração de dados é uma técnica que quando bem executada possuí poder natural poder ... -
Desenvolvimento de ProClaT, uma ferramenta computacional para a classificação de proteínas : o caso "DraB" de Azospirillum brasiliense
(2010)Resumo: Azopirillum brasilense é uma bactéria fixadora de nitrogênio que promove o crescimento vegetal e é utilizada como bio-fertilizante na agricultura. Uma vez que o processo demanda um alto gasto de energia, a redução ... -
Identificação de homólogos e análise de vizinhança dos genes draTG envolvidos na regulação da fixação biológica de nitrogênio
(2015)Resumo: Nitrogenase é a enzima responsável pelo processo de Fixação Biológica de Nitrogênio (FBN), no qual o gás dinitrogênio é reduzido para amônia por microorganismos. Em algumas bactérias fixadoras de nitrogênio, como ... -
Procura in sílico por genes de tripanosomatídeos com possível função regulatória do sistema complemento humano
(2014)Resumo: O Trypanosoma cruzi e o agente causador da doença de Chagas e possui um ciclo de vida complexo que alterna entre hospedeiros invertebrados e vertebrados. O ciclo do T. cruzi no hospedeiro vertebrado inicia-se na ... -
Wedring : pipeline para análise de expressão diferencial em experimento de RNA-Seq
(2013)Resumo: Transcriptoma e o conjunto completo de transcritos de uma célula em uma dada condição fisiológica e/ou de desenvolvimento. Atualmente, ha varias abordagens para se estudar o transcriptoma, tal como a tecnologia de ... -
Identificação e análise de promotores Sigma 70 no genoma de Herbaspirillum seropedicae SmR1 utilizando métodos de inteligência artificial
(2014)Resumo:Sigma 70 ou sigma N constituem fatores complementares da RNA-polimerase, cuja principal função é promover a transcrição de genes procarióticos. No caso de Escherichia coli, o consenso da região -35 (TTGACA) e -10 ... -
Sistema computacional baseado em aprendizado de maquina para posicionamento taxonômico de bactérias utilizando dados fenotípicos
(2013)As bactérias são organismos unicelulares que apresentam ampla diversidade morfológica, metabólica e ecológica. Estes microrganismos pertencem ao Domínio Bactéria que, atualmente, conta com 52 Filos. A taxonomia bacteriana ... -
Re-anotação do genoma de Herbaspirillum seropedicae SmR1 com dados de transcriptoma por RNA_Seq
(2014)Resumo: As plantas necessitam do Nitrogênio para sintetizar várias moléculas que são essenciais para sua sobrevivência, porém, não conseguem fixá-lo a partir do ar atmosférico. É neste contexto que entram em cena as bactérias ... -
Desenvolvimento da ferramenta para finalização de montagens de genomas in silico - FGAP
(2014)Resumo: A finalização é a etapa que consome mais tempo e demanda maior esforço em projetos de determinação de sequências genômicas. Diversos métodos computacionais (in silico) foram propostos com o objetivo de resolver ... -
Identificação de Splicing alternativo em sítios de início de transcrição de mRNAS de arroz utilizando dados de RNA-Seq.
(2012)Resumo: RNA-Seq é uma técnica que permite quantificar os níveis de expressão de uma forma muito mais precisa do que os métodos empregados anteriormente. Estudos que utilizaram esse método já alteraram a visão da extensão ... -
SILA
(2013)Resumo: Na Bioinformática, a comparação de sequências é uma tarefa essencial para diversas atividades e é onde geralmente se tem o maior custo computacional. A anotação de genomas é uma atividade que envolve tarefas ... -
Segmentação e análise de imagens digitais de metáfases cromossômicas em bandeamento G
(2013-11-19)Resumo: A possibilidade de auxiliar diagnósticos genéticos, como na identificação de anomalias, com resultados em curto espaço de tempo, agiliza e direciona condutas de tratamento. O desenvolvimento do sistema semiautomático ... -
BioSom
(2013-09-11)Resumo: Genes e proteínas são de grande importância biológica para a compreensão de processos bioquímicos e requerem nomes consistentes. Existem diversas diretrizes para nomenclatura de genes, mas elas não são rigorosamente ... -
Avaliação quantitativa de sistemas preditores de função de proteinas
(2013-05-21)Resumo: Este trabalho propõe aprofundar as avaliações dos sistemas preditores de função de proteína que utilizam como dado de entrada a sequência de uma proteína, podendo na sua conclusão determinar qual a melhor estratégia ... -
Metodologia de busca de similaridade de genes por matriz de co-ocorrência
(2013-05-16)Resumo: O barateamento das tecnologias de sequencimento de DNA têm resultado em um aumento expressivo de novos organismos sequenciados. No estudo destes dados cientistas utilizam o alinhamento de sequência de nucleotídeos ... -
Utilização de técnicas de otimização de desempenho em bioinformática
(2012-12-12)Resumo: A área de bioinformática passou por um crescimento na quantidade de dados biológicos em formato digital devido ao desenvolvimento de novas tecnologias de sequenciamento de DNA e análise de expressão gênica. A base ...