40001016066P4 Programa de Pós-Graduação em Bioinformática
Recent Submissions
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Identificação in silico de sítios de ligação à proteína regulatória NTRC em sequências genômicas
(2019)Resumo: O nitrogênio é um elemento essencial para a manutenção da vida na Terra. Apesar disso sua maior concentração está presente na atmosfera. Algumas proteobactérias possuem o sistema Ntr, que é responsável pelo processo ... -
PreProcSEQ : pipeline de controle de qualidade e pré-processamento de dados de RNA-Seq
(2022)Resumo: O sequenciamento de RNA através de sequenciadores de nova geração é denominado de RNA-Se , este sequenciamento permite estimar a abundância de transcritos e a identificação de genes diferencialmente expressos entre ... -
Quando há muito o que ser dito : utilização de técnicas de inteligência artificial e análise de sentimentos para classificação de textos relacionados ao suicídio
(2022)Resumo: Segundo dados da Organização Mundial da Saúde, anualmente, mais de 700 mil pessoas morrem por suicídio no mundo. Nesse contexto, buscou-se no presente artigo utilizar-se das técnicas de inteligência artificial e ... -
Análise da incompletude na inferência estatística : uma aplicação em dados clínicos
(2017)Resumo: Lacunas são comuns a pesquisa empírica, em especial na área da saúde, onde a falta de dados é muitas vezes um fator inevitável devido à logística da captação de informações. Essa incompletude é danosa à análise de ... -
Biopen : ferramenta computacional para coleta e análise de dados laboratoriais de enteropatógenos
(2011)Resumo: A presente pesquisa propõe o desenvolvimento da ferramenta computacional chamada BIOPEN, na área biológica para coletar, armazenar e gerar informações sobre características de Enteropatógenos bacterianos obtidas ... -
Montagem, anotação e comparação do genoma parcial da bactéria Azoarcus olearius DQS4
(2015)Resumo: Existem na natureza bactérias capazes de transformar o nitrogênio existente no ar em amônia, um processo denominado Fixação Biológica de Nitrogênio (FBN), e transferi-lá para plantas nessa forma a qual consigam ... -
Tacos : avaliação de árvores filogenéticas
(2021)Resumo: O estudo das relações entre sequências genéticas auxiliam diversas áreas biológicas. A filogenia pode ajudar a entender histórias e processos evolutivos, como estudo das migrações e dinâmica social. A filogenia ... -
Desenvolvimento de ferramenta computacional para identificação de promotores Sigma 54 utilizando rede neural artificial
(2012)Resumo: A transcrição de vários genes bacterianos é regulada por fatores sigma alternativos da RNA polimerase como o sigma 54 ou sigma N. A sequência consenso (mrNrYTGGCACG-N4-TTGCWNNw) do fator sigma 54 esta localizada ... -
Web GAAT : a web tool for genome analysis and annotation
(2017)Resumo: A grande quantidade de dados genômicos, obtidos através de sequenciadores automáticos de DNA de nova geração, os NGS, tem possibilitado o estudo de genomas em níveis inéditos. Embora existam diferentes programas ... -
Oroboro : modelo para descrição temporal do átomo de hidrogênio através da feature resonance neural network
(2020)Resumo: Com importância ampla e inquestionável, o estudo da modelagem e dinâmica moleculares necessita constantemente de avanços e o desenvolvimento de novas técnicas é bem-vindo. O aprendizado de máquina vem sendo ... -
Modelo computacional para comparação de táxons : filogenia global e mineração de dados na família Formicidae
(2021)Resumo: Formigas são consideradas "engenheiras do ecossistema" pois oferecem inúmeros serviços ecológicos e têm impacto na produção de sistemas agrícolas. A interação delas com o ambiente pode afetar desde a composição do ... -
Identificação de variantes de splicing alternativo de RNAs não codificadores no transcriptoma de carcinoma cervical de células escamosas e adenocarcinoma cervical
(2019)Resumo: A porção inicial do útero que realiza a comunicação com o canal vaginal é chamada de cérvice uterina. Nessa região pode-se desenvolver o câncer cervical, também conhecido popularmente como câncer de colo de útero. ... -
Biotex : mineração de textos inspirada em técnicas de bioinformática
(2020)Resumo: A mineração de textos trata da obtenção de informação a partir do processamento de dados não estruturados, escritos em linguagem natural. A grande quantidade de conteúdo textual digitalizado disponível através da ... -
Análise in silico de sequências de DNA de regiões genômicas associadas ao sistema CRISPR
(2019)Resumo: As repetições palindrômicas curtas, interespaçadas e regularmente agrupadas - CRISPR - formam um sistema de imunidade adquirida em bactérias e arqueas. O CRISPR é um dos sistemas mais estudados na última década, ... -
Análise e caracterização de grandes grupos de proteínas utilizando técnicas de mineração de dados
(2019)Resumo: Nas últimas décadas com o rápido desenvolvimento de disciplinas como a genômica e a proteômica, a quantidade de informação biológica que é produzida e armazenada diariamente nos Bancos de Dados de proteínas tem ... -
Análise de ilhas genômicas a partir de clusterização de proteínas
(2021)Resumo: A resistência antimicrobiana e reconhecida como uma das mais graves ameaças globais para a saúde humana no século 21. Um importante mecanismo na adaptação de microrganismos esta presente nas Ilhas Genômicas (GIs). ... -
Análise de interatomas centrados no receptor FGFR2 : potenciais alvos terapêuticos na câncer de mama
(2018)Resumo: Em doenças heterogêneas, como o câncer de mama, muitos são os fatores que adicionam pontos de fragilidade que contribuem para o inicio e a progressão do tumor. Segundo estudos de associação de genomas (GWAS), uma ... -
Identificação e avaliação de padrões repetitivos no proteoma de Trypanosoma Cruzi
(2019)Resumo: Regiões repetidas são primordiais para a sobrevivência de Trypanossoma cruzi, pois tem sido atribuído a elas um papel importante no processo de evasão do sistema imune de hospedeiros mamíferos. A compreensão de ... -
Perfis de atividade de regulon : inferência e aplicações
(2019)Resumo: O entendimento do câncer é um dos desafios cruciais da ciência atual. Em busca desta compreensão, governos e institutos em todo o mundo estão gerando uma abundância de dados biológicos. Dentre os tipos de dados, ... -
Análise filogenética da região codificante do genoma plastidial : uma abordagem livre de alinhamento utilizando o algoritmo SVect
(2018)Resumo: Com o advento do sequenciamento massivo paralelo de DNA, o campo da bioinformática tornou-se desafiador no que diz respeito a análises genômicas envolvendo Big Data. A filogenômica possui duas principais abordagens ...
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