Avaliação de polimorfismos no gene TMPRSS2 em estudo caso-controle na Covid-19

Abstract

Resumo: A pandemia da COVID-19 representou um dos mais significativos desafios para pesquisadores e provedores de saúde. Vários fatores determinam a gravidade da doença, enquanto nenhum sozinho pode explicar a tremenda variabilidade. As variantes de nucleotídeo único no gene da serina protease transmembrana tipo 2 (TMPRSS2) afeta a entrada do vírus e é considerado um possível fator de risco para a COVID-19. O objetivo deste trabalho foi avaliar se os polimorfismos rs75603675 (C>A) e rs17458725 (A>G), do gene TMPRSS2 está associado ao COVID-19, em uma população Sul Brasileira. Este estudo caso-controle foi aprovado pelo Comitê de Ética da Universidade Federal do Paraná sob o número CAAE: 43948621.7.0000.0102. Foram incluídos no estudo 247 indivíduos, classificados como controle (sem viremia, n=130) e grupo COVID-19 (n=117), pareados por gênero e idade. As genotipagens foram realizadas com sondas fluorescentes (Taqman SNP genotyping assay, Applied Biosystems) em sistema de PCR em tempo real (7500 Fast real-time PCR (Applied Biosystems). Parâmetros laboratoriais como a glicemia de jejum e HbA1c, entre outros ensaios de rotina foram quantificados em sistema automatizado LabMax 400. Os polimorfismos em estudo estão no equilíbrio de Hardy-Weinberg. As frequências alélicas e genotípicas não foram diferentes para todos os polimorfismos nos grupos em estudo (P>0,05). Para os grupos controle e COVID-19, respectivamente, os alelos de menor frequência (MAF) para o rs75603675 (Alelo-A), foi 37,3% (95%IC, 31-43) e 37,2% (95%IC, 31-43) e rs17458725 (Alelo-G), 47.7% (95%IC, 42-54) e 50,4% (95%IC, 44-57). Os polimorfismos em estudo não foram associados à COVID-19 na população do sul do Brasil e os alelos para os polimorfismos apresentaram frequências similares à população iraniana tanto para o grupo COVID-19 quanto para o grupo controle

Abstract: The COVID-19 pandemic represented one of the most significant challenges for researchers and healthcare providers. Several factors determine the severity of the disease, yet none alone can explain the tremendous variability. Single nucleotide variants in the transmembrane serine protease 2 (TMPRSS2) gene affect viral entry and are considered a potential risk factor for COVID-19. The aim of this study was to evaluate whether the polymorphisms rs75603675 (C>A) and rs17458725 (A>G) in the TMPRSS2 gene are associated with COVID-19 in a Southern Brazilian population. This case-control study was approved by the Ethics Committee of the Federal University of Paraná under protocol number CAAE: 43948621.7.0000.0102. A total of 247 individuals were included in the study, classified as control (no viremia, n=130) and COVID-19 group (n=117), matched by gender and age. Genotyping was performed using fluorescent probes (Taqman SNP genotyping assay, Applied Biosystems) on a real-time PCR system (7500 Fast real-time PCR, Applied Biosystems). Laboratory parameters such as fasting glucose and HbA1c, among other routine assays, were quantified using the LabMax 400 automated system. The studied polymorphisms were in Hardy-Weinberg equilibrium. Allelic and genotypic frequencies did not differ for any polymorphism between the study groups (P>0.05). For the control and COVID-19 groups, respectively, the minor allele frequencies (MAF) for rs75603675 (Allele-A) were 37.3% (95%CI, 31-43) and 37.2% (95%CI, 31-43), and for rs17458725 (Allele-G), 47.7% (95%CI, 42-54) and 50.4% (95%CI, 44-57). The studied polymorphisms were not associated with COVID-19 in the Euro-Brazilian population analyzed, and the allele frequencies for the polymorphisms were similar to those reported in the Iranian population for both the COVID-19 and control groups