Caracterização de isolados de Acinetobacter baumannii multirresistentes a antimicrobianos obtidos de pacientes internados em um hospital terciário durante a pandemia de Covid-19

Abstract

Resumo: Durante a pandemia causada pelo coronavírus da síndrome respiratória aguda grave 2 (SARS-CoV-2), foi observado um aumento na prevalência das Infecções Relacionadas à Assistência à Saúde (IRAS), o que pode estar relacionado aos diversos fatores de risco aos quais os pacientes estão propensos durante a hospitalização. As IRAS constituem uma das maiores causas de morbimortalidade em pacientes hospitalizados, sendo que o bacilo gram-negativo Acinetobacter baumannii representa aproximadamente 20% dos isolados de pacientes em unidades de terapia intensiva (UTI). Este patógeno possui muitos fatores de virulência e mecanismos de resistência, o que favorece sua permanência no ambiente nosocomial sendo considerado um patógeno oportunista. Desta forma, o objetivo do presente trabalho foi caracterizar isolados de A. baumannii resistentes a carbapenemicos obtidos a partir de amostras clínicas dos pacientes internados no Complexo Hospital de Clínicas da Universidade Federal do Paraná (CHC-UFPR), durante os anos de 2020 e 2021. Para isso, os isolados tiveram a identificação da espécie confirmada através de espectrometria de massa pelo sistema de matriz associada a dessorção-ionização a laser em tempo de voo (MALDI-TOF) e os genes de resistência a carbapenemicos identificados através da técnica de reação em cadeia da polimerase (PCR). Além disso foram analisados dados dos testes de suscetibilidade a antimicrobianos (TSA) e dados clínicos obtidos a partir do Sistema de Informação Hospitalar (SIH) do CHC-UFPR. De um total de 83 isolados de Acinetobacter spp. avaliados, 70(84,33%) foram identificados como A. baumannii. Através da PCR a produção de carbapenemases, 70 (84,33%) foram positivos para as carbapenemases OXA-51 e OXA-23. Também foi detectado a presença de OXA- 143 em 8 isolados de Acinetobacter spp. A maior frequência de isolados foi em pacientes admitidos em UTIs e o percentual de óbitos foi 60,24%. Os isolados apresentaram resistência a todas as drogas avaliadas exceto polimixina B. O sistema MALDI-TOF apresentou um percentual de acerto na identificação do isolados Acinetobacter spp. acima de 80%. Conclusão: Neste estudo foram detectados a presença do gene carbapenemase blaoxA-23 em mais de 80% dos isolados. Sabe-se que essa carbapenemase em A. baumannii. é bem difundida no Brasil e no mundo. O sistema MALDI-TOF demonstrou ser uma boa opção para identificação rápida e de rotina dos isolados do complexo ACB.

Abstract: During the pandemic caused by the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), an increase in the prevalence of Healthcare-Associated Infections (HAIs) was observed, which may be related to several risk factors to which patients were exposed during hospitalization. HAIs identify as one of the biggest causes of morbidity and mortality in hospitalized patients, with the gram-negative bacillus Acinetobacter baumannii representing approximately 20% of isolates from patients in intensive care units (ICU). This pathogen has many virulence factors and resistance mechanisms, which favors its permanence in the nosocomial environment and is considered an opportunistic pathogen. Thus, the objective of the present work was to characterize isolates of A. baumannii resistant to carbapenems obtained from clinical samples from patients admitted to the Complexo Hospital de Clínicas of the Federal University of Paraná (CHC-UFPR), during the years 2020 and 2021. For this, the isolates had their species identification confirmed through mass spectrometry using the matrix system associated with laser desorption-ionization in time of flight (MALDITOF) and the carbapenem resistance genes identified through polymerase chain reaction (PCR). In addition, data from antimicrobial susceptibility tests (ATS) and clinical data obtained from the CHC-UFPR Hospital Information System (SIH) were analyzed. From a total of 83 isolates of Acinetobacter spp. evaluated, 70 (84.33%) were identified as A. baumannii. Through PCR, the production of carbapenemases, 70 (84.33%) were positive for the carbapenemases OXA-51 and OXA-23. The presence of OXA-143 was also detected in 8 isolates of Acinetobacter spp. The highest frequency of isolates was in patients admitted to ICUs and the percentage of deaths was 60.24%. The isolates showed resistance to all drugs evaluated except polymyxin B. The MALDI-TOF system showed a percentage of success in identifying Acinetobacter spp. above 80%.Conclusion: In this study, the presence of the blaOXA-23 carbapenemase gene was detected in more than 80% of the isolates. This carbapenemase is known to occur in A. baumannii. It is widespread in Brazil and around the world. The MALDI-TOF system proved to be a good option for rapid and routine identification of ACB complex isolates.