Sistema integrado para anotação automática de genomas
Data
2013Autor
Santos, Fábio Roberto Stella
Prostt, Jackson Augusto
Vialle, Ricardo Assunção
Raittz, Roberto Tadeu, 1966-
Universidade Federal do Paraná. Setor de Educação Profissional e Tecnológica. Curso de Graduação em Tecnologia em Análise e Desenvolvimento de Sistemas
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Resumo : Apresentamos um sistema web para anotação de genomas de procariotos integrado a ferramenta SILA. O sistema tem por objetivo, fornecer o serviço da anotação automática de genomas em ambiente web, oferecendo opções para visualização e analise das informações. O sistema utiliza HTML5 para representação gráfica interativa das informações de anotação, fornecendo visualização do mapa genômico e de agrupamentos por produtos de proteínas, funções e por organismos vizinhos baseado nos genes anotados. Além das informações obtidas a partir anotação do SILA, o sistema associa dados do repositório de enzimas ENZYME. O sistema está disponível através do página do programa de pós-graduação em Bioinformática da UFPR pelo endereço www.bioinfo.ufpr.br/sila.