Caracterização molecular de bactérias endofíticas antagonistas isoladas de flores de espécies frutíferas

Abstract

Resumo: O Brasil é um dos maiores produtores de frutas do mundo, desta forma, o controle de doenças que acometem flores e frutos é de grande importância. Dentre os desafios para fruticultura no controle de doença, o longo período de carência de fungicidas devido ao consumo direto das frutas é um desafio. O controle biológico é uma alternativa promissora e se destaca por promover a diminuição da pressão de seleção de patógenos resistentes à fungicidas e ser alternativa para manejo em janelas de risco. O objetivo deste trabalho foi identificar molecularmente quatro isolados bacterianos endofíticos obtidos de flores frutíferas, provenientes dos estados do Paraná e Santa Catarina. Os isolados obtidos apresentaram potencial antagonista aos fitopatógenos Alternaria alternata da tangerina, Botrytis cinerea do morango, Monilinia fructicola do pêssego e Sclerotinia sclerotiorum da soja. O DNA total de cada bactéria foi extraído e utilizado como molde para amplificação por PCR da região 16S rRNA. Em seguida, os amplicons, com aproximadamente 1500 pb, foram sequenciados e utilizados para elaboração de árvores filogenéticas. Os fragmentos amplificados apresentaram identidade com espécies do gênero Paenibacillus, Pantoea, Pseudomonas e Bacillus. Os resultados demostram a necessidade da utilização de genes adicionais para que seja possível a identificação das espécies

Abstract: Brazil is one of the largest fruit producers in the world, therefore, controlling diseases that affect flowers and fruits is of great importance. Among the challenges for fruit growing in disease control are the care of bees during flowering and the long period of lack of fungicides due to direct consumption of the fruits (risk windows). Biological control is a promising alternative and stands out for promoting a reduction in selection pressure for fungicide-resistant pathogens and being an alternative for management in risk windows. The objective of this work was to molecularly identify four endophytic bacterial isolates obtained from fruit flowers, from the states of Paraná and Santa Catarina. The isolates obtained showed antagonistic potential to the phytopathogens Alternaria alternata, Botrytis cinerea, Monilinia fructicola and Sclerotinia sclerotiorum. Total DNA from each bacterium was extracted and used as a template for PCR amplification of the 16S region. Then, the amplicons, measuring approximately 1500 bp, were sequenced and used to create phylogenetic trees. The amplified fragments showed identity to species of the genus Paenibacillus, Pantoea, Pseudomonas and Bacillus. The results demonstrate the need to use additional genes so that species identification is possible