• Login
    View Item 
    •   DSpace Home
    • BIBLIOTECA DIGITAL: Trabalhos de Graduação
    • Análise e Desenvolvimento de Sistemas
    • View Item
    •   DSpace Home
    • BIBLIOTECA DIGITAL: Trabalhos de Graduação
    • Análise e Desenvolvimento de Sistemas
    • View Item
    JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

    Sistema para gerenciamento de projetos de sequenciamento de fungos

    Thumbnail
    View/Open
    Vieira.pdf (4.149Mb)
    CODIGO_FONTE_2016_VIEIRA.zip (13.11Mb)
    Date
    2016
    Author
    Vieira, Allan Costa
    Melo, Fernando de Oliveira
    Metadata
    Show full item record
    Subject
    Análise e desenvolvimento de sistemas
    Bioinformática
    Sequenciamento de nucleotídeos de alto rendimento
    Software - Desenvolvimento
    xmlui.dri2xhtml.METS-1.0.item-type
    Monografia Graduação Digital
    Abstract
    Apesar dos fungos serem extremamente importantes na decomposição da matéria orgânica e no ciclo dos nutrientes, eles estão envolvidos em várias doenças que acometem seres humanos, por isso é de grande importância o estudo do organismo dos fungos realizado pelo PPG-BIOINFO, que tem como objetivo o sequenciamento genético de fungos patogênicos para melhor compreensão das causas da patogenicidade e possíveis curas. Arquivos GBK, GFF e Fasta podem guardar as mais diversas informações genéticas de um organismo, sendo amplamente utilizados na Bioinformática, porém, cada formato de arquivo as armazena de forma diferente. Este trabalho apresenta um sistema web capaz de armazenar e converter os arquivos do formato GBK para os formatos Fasta, assim como disponibiliza-los para download. O formato GBK é de propriedade do NCBI GenBank (NCBI, 2016), um dos mais utilizados bancos de dados primários, e que tem centralizado boa parte das informações obtidas pelos processos de sequenciamento de DNA e/ou RNA de fungos patogênicos, separando em arquivos únicos e formato específico cada organismo, cromossomo ou plasmídeo completamente sequenciado com seus genomas e anotações. Por isso também a preferência por trabalhar nesse arquivo como fonte primária de disponibilização e armazenamento. O sistema também funcionará como uma plataforma de trabalho, facilitando o armazenamento e visualização de arquivos genéticos e possibilitando que o andamento dos projetos seja facilmente consultado, arquivos disponibilizados e usuários gerenciados de acordo com uma hierarquia estabelecida.
    URI
    https://hdl.handle.net/1884/44820
    Collections
    • Análise e Desenvolvimento de Sistemas [324]

    DSpace software copyright © 2002-2016  DuraSpace
    Contact Us | Send Feedback
    Theme by 
    Atmire NV
     

     

    Browse

    All of DSpaceCommunities & CollectionsBy Issue DateAuthorsTitlesSubjectsxmlui.ArtifactBrowser.Navigation.browse_typeThis CollectionBy Issue DateAuthorsTitlesSubjectsxmlui.ArtifactBrowser.Navigation.browse_type

    My Account

    LoginRegister

    Statistics

    View Usage Statistics

    DSpace software copyright © 2002-2016  DuraSpace
    Contact Us | Send Feedback
    Theme by 
    Atmire NV