Navegação Dissertações por tipo "Dissertação"
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Análise comparativa das ferramentas de predição de ilhas genômicas
(2017)Resumo: Ilhas genômicas são segmentos de DNA em organismos procariotos, que apresentam características que diferem das demais regiões do genoma. As principais características são: conteúdo GC% distinto do genoma; presença ... -
Análise da incompletude na inferência estatística : uma aplicação em dados clínicos
(2017)Resumo: Lacunas são comuns a pesquisa empírica, em especial na área da saúde, onde a falta de dados é muitas vezes um fator inevitável devido à logística da captação de informações. Essa incompletude é danosa à análise de ... -
Análise de sequências de DNA metagenômico de solos da Floresta Atlântica paranaense : implicações ecológicas e biotecnológicas
(2017)Resumo: A Floresta Atlântica Paranaense é um dos 25 hotspots de biodiversidade do mundo, sendo conhecida por sua grande diversidade de fauna e flora. Mas pouco se sabe sobre a diversidade microbiana de seu solo. A Metagenômica ... -
Avaliação quantitativa de sistemas preditores de função de proteinas
(2013-05-21)Resumo: Este trabalho propõe aprofundar as avaliações dos sistemas preditores de função de proteína que utilizam como dado de entrada a sequência de uma proteína, podendo na sua conclusão determinar qual a melhor estratégia ... -
Banco de dados biológico no modelo relacional para mineração de dados em genomas completos de procariotos disponibilizados pelo NCBI GenBank
(2012-04-09)Resumo: O NCBI GenBank, um dos três principais bancos de dados primários, tem centralizado as informações obtidas pelos processos de sequenciamento de DNA e/ou RNA e as tem distribuído no formato de arquivos textos. Nos ... -
Bioinformática aplicada à unificação dos bancos de histocompatibilidade dos laboratórios de imunogenética do Hospital de Clínicas e Genética Molecular Humana da UFPR
(2012-04-09)Resumo: O Laboratório de Imunogenética do Hospital das Clínicas (LIHC) da Universidade Federal do Paraná (UFPR) dispõe de um grande volume de dados de tipagens HLA de familiares de pacientes, que foram cadastrados em um ... -
Biopen : ferramenta computacional para coleta e análise de dados laboratoriais de enteropatógenos
(2011)Resumo: A presente pesquisa propõe o desenvolvimento da ferramenta computacional chamada BIOPEN, na área biológica para coletar, armazenar e gerar informações sobre características de Enteropatógenos bacterianos obtidas ... -
BioSom
(2013-09-11)Resumo: Genes e proteínas são de grande importância biológica para a compreensão de processos bioquímicos e requerem nomes consistentes. Existem diversas diretrizes para nomenclatura de genes, mas elas não são rigorosamente ... -
Consolidação e validação da ferramenta Rapid Alignment Free Tool for Sequences Similarity Search to Groups (RAFTS3GROUPS) : um software rápido de clusterização para big data e buscador consistente de proteínas ortólogas
(2016)Resumo: Uma das principais análises envolvendo sequências biológicas, imprescindíveis e complexas, é a análise de homologia. A necessidade de desenvolver técnicas e ferramentas computacionais que consigam predizer com mais ... -
Desenvolvimento de ProClaT, uma ferramenta computacional para a classificação de proteínas : o caso "DraB" de Azospirillum brasiliense
(2010)Resumo: Azopirillum brasilense é uma bactéria fixadora de nitrogênio que promove o crescimento vegetal e é utilizada como bio-fertilizante na agricultura. Uma vez que o processo demanda um alto gasto de energia, a redução ... -
Desenvolvimento e validação de sistema de apoio à decisão em urinálise com inteligência artificial utilizando redes neuronais
(2011)Resumo: A urinálise contempla uma avaliação semi-quantitativa de analitos e contagem diferencial de células presentes na urina. A análise fornece informações diagnósticas relevantes principalmente sobre o sistema urinário ... -
Estudo da aplicação de redes neuronais artificiais para apoio à decisão na liberação do perfil lipídico e de glicemia em jejum.
(2011)Resumo: As determinações do perfil lipídico (colesterol total, HDL-colesterol, LDL-colesterol, triglicérides) e da glicemia em jejum são ensaios de grande demanda nos laboratórios clínicos. A liberação destes resultados ... -
Identificação de homólogos e análise de vizinhança dos genes draTG envolvidos na regulação da fixação biológica de nitrogênio
(2015)Resumo: Nitrogenase é a enzima responsável pelo processo de Fixação Biológica de Nitrogênio (FBN), no qual o gás dinitrogênio é reduzido para amônia por microorganismos. Em algumas bactérias fixadoras de nitrogênio, como ... -
Identificação de Splicing alternativo em sítios de início de transcrição de mRNAS de arroz utilizando dados de RNA-Seq.
(2012)Resumo: RNA-Seq é uma técnica que permite quantificar os níveis de expressão de uma forma muito mais precisa do que os métodos empregados anteriormente. Estudos que utilizaram esse método já alteraram a visão da extensão ... -
Identificação e análise de promotores Sigma 70 no genoma de Herbaspirillum seropedicae SmR1 utilizando métodos de inteligência artificial
(2014)Resumo:Sigma 70 ou sigma N constituem fatores complementares da RNA-polimerase, cuja principal função é promover a transcrição de genes procarióticos. No caso de Escherichia coli, o consenso da região -35 (TTGACA) e -10 ... -
JMSA : Java Mass Spectrometry Analyzer: ferramenta para gerenciamento e análise de banco de espectros de massa para identificação de microrganismos
(2017)Resumo: A utilização da espectrometria de massa MALDI-TOF permite a identificação de microrganismos através da geração de espectros de massa, representando um perfil característico de sinais obtidos a partir de peptídeos ... -
Mapeamento de genes nif publicados no NCBI usando conceitos de mineração de dados e inteligência artificial
(2012-10-10)Resumo: A Fixação Biológica de Nitrogênio é um importante processo biosustentável, aplicado na agricultura sob a forma de biofertilizantes. Na FBN ocorre a redução do dinitrigênio gasoso (N2) à amônia (NH4), mediante ... -
Metodologia computacional para estudo de genes com vizinhaça conectada : análise do cluster nif
(2015)Resumo: A atividade da nitrogenase é vital para a manutenção da vida terrestre e fonte de conhecimento para diversos campos científicos. Mineração de dados é uma técnica que quando bem executada possuí poder natural poder ... -
Metodologia de busca de similaridade de genes por matriz de co-ocorrência
(2013-05-16)Resumo: O barateamento das tecnologias de sequencimento de DNA têm resultado em um aumento expressivo de novos organismos sequenciados. No estudo destes dados cientistas utilizam o alinhamento de sequência de nucleotídeos ...