Variabilidade genética de populações cativas de Rhamdia quelen a partir de marcadores microssatélites

Abstract

O presente estudo teve como objetivo analisar a variabilidade e estrutura genética, através do uso de marcadores moleculares microssatélites, de duas populações cativas de Rhamdia quelen oriundas de rios da região Sul do Brasil. Ambas as populações pertencem a estoques de reprodutores do Campo Experimental de Piscicultura de Camburiú - CEPC. O DNA dos individuos foi obtido a partir de tecidos de nadadeiras com auxilio de um kit extração comercial. Para a amplificação via PCR foram utilizados seguintes primers marcados com fluoroforos: Pcor1 (FAM), Pcor2 (TET), Pc17 (HEX), Pc97 (TET) e Rh1 (FAM). Depois de amplificadas, as amostras de DNA foram submetidas à eletroforese capilar e genotipadas. Os cinco loci de microssatélites analisados apresentaram-se altamente polimórficos e informativos, com uma média de 9,8 alelos/locus. As populações não se encontram em equilibrio de Hardy-Weinberg (HWE), apresentando desvios significativos (p<0,01) na maioria dos locus analisados. O coeficiente de endogamia (Fis) apresentou valores negativos, evidenciando que não houve cruzamentos consanguineos. O teste de diferenciação alélica e genotipica entre as duas populações foi estatisticamente significativo, e o valor de divergência genética total (FST) foi de 0,01939, indicando baixo nivel de estruturação genética nas populações. A análise de variância molecular (AMOVA) demonstrou que a maior variabilidade genética se encontra dentro das populações (98,06%). Os marcadores microssatélites utilizados foram eficientes para a análise da estrutura e variabilidade genética das populações cativas de Rhamdia quelen. O manejo reprodutivo adotado nos cultivos do CEPC mostrou-se adequado, uma vez que garantiu a manutenção da variabilidade genética das populações. Isto reforça a possibilidade destas fazerem parte de uma população base de programas de melhoramento.

Palavras-chave: Jundiá, piscicultura, melhoramento genético, marcador molecular, estrutura genética.

The present study aimed to analyze the genetic variability and structure, of two farmed populations of Rhamdia quelen originating from rivers in southern Brazil through the use of microsatellite markers. Both populations belong to the breeding stocks of the experimental fish farming station of Camburiú CEPC. The DNA of individuals was obtained from fin tissue using a commercial extraction kit. For PCR amplification the following primers labeled with fluorophores were used: Pcor1 (FAM), Pcor2 (TET), PC17 (HEX), PC97 (TET) and Rh1 (FAM). After amplification, DNA samples were subjected to capillary electrophoresis and genotyped. The five microsatellite loci analyzed were highly polymorphic and informative, with an average of 9,8 alleles/locus. The two opulations are not in Hardy-Weinberg equilibrium (HWE), showing significant deviations (p<0.01) in most loci analyzed. The inbreeding test of coefficient (FIS) was negative, indicating that there was no inbreeding. The test allelic and genotypic differentiation between the two populations was statistically significant, and the value of the total genetic divergence (FST) was 0.01939, indicating a low level of genetic structure in populations. The analysis of molecular variance (AMOVA) showed that most genetic variation was found within populations (98.06%). Microsatellite markers used were efficient for analysis of the structure and genetic variability of farmed populations of Rhamdía quelen. The reproductive management adopted in the farming system of CEPC was adequate, since it ensured the maintenance of genetic variability. This reinforces the possibility of these populations being part of a population-based of breeding programs.

Key-words: Silver catfish, pisciculture, breeding, molecular marker, genetic structure.