Obtenção de modelo tridimensional para o antígeno ML2055 de Mycobacterium leprae

Abstract

Resumo: A hanseníase é uma doença granulomatosa crônica causada pelo Mycobacterium leprae que data de tempos antigos. Contudo se mantém como um problema de saúde pública em países em desenvolvimento como o Brasil. Trata-se de uma doença com acometimento cutâneo e nervoso que pode levar a desfiguração e incapacidade do indivíduo acometido. Seu tratamento custa milhões aos cofres públicos todos os anos. Objetivos: Obter um modelo de estrutura tridimensional para a proteína ML2055 de M. leprae com potencial imunogênico para o desenvolvimento de teste sorodiagnóstico capaz de detectar a forma paucibacilar da hanseníase. Métodos: Modelagem molecular da proteína alvo por meio de ferramentas de bioinformática. Modelagem por predição de enovelamento (Threading) disponível no I-Tasser. Modelagem através da técnica ab initio realizada no servidor Robetta fornecido pela plataforma ROSETTA. Resultados: O primeiro método a ser utilizado sugeriu como molde um homo-hexâmero de M. tuberculosis, a proteína 5ZX9 que foi alinhada com a proteína ML2055. Incialmente o molde pareceu satisfatório, entretanto foi incapaz de acrescentar os 54 aminoácidos da porção amino-terminal na estrutura final da proteína. O segundo método utilizado foi eficaz em resolver a estrtura amino-terminal da proteína, contudo com diversas inconsistências que invalidaram o modelo. O método, por fim, utilizado foi a técnica ab initio que forneceu uma estrutura monohexamérica que além de modelar a porção amino-terminal faltante no primeiro modelo também respeitou as propriedades físicoquímicas dos aminoácidos, suas posições nos ângulos diedros ? e ?, bem como a compatibilidade entre a estrutura tridimensional sugerida e a sequência primária da proteína alvo. Conclusão: O modelo obtido na realização do trabalho deixou claro que uma alta identidade entre as sequências primárias do molde e da proteína alvo não são suficientes para validação do modelo, evidenciando que uma análise superficial das variáveis pode levar a modelos errôneos que não condizem com o comportamento da proteína in vivo. Além disso, regiões de coil são permitidas no modelo final desde que todas as regras sejam respeitadas. Por meio desses resultados será possível localizar espacialmente os peptídeos experimentalmente imunogênicos passíveis de serem usados em ensaios clínicos para o desenvolvimento de teste sorodiagnóstico capaz de identificar as diferentes formas da doença