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Consolidação e validação da ferramenta Rapid Alignment Free Tool for Sequences Similarity Search to Groups (RAFTS3GROUPS) : um software rápido de clusterização para big data e buscador consistente de proteínas ortólogas
(2016)
Resumo: Uma das principais análises envolvendo sequências biológicas, imprescindíveis e complexas, é a análise de homologia. A necessidade de desenvolver técnicas e ferramentas computacionais que consigam predizer com mais ...
Análise filogenética do sistema de dois componentes NtrY/NtrX em bactérias
(2018)
Resumo: As bactérias conseguem viver e se adaptar em diferentes tipos de ambientes; essa característica é essencial para o sucesso da espécie. O mecanismo capaz de perceber e responder os mais diferentes estímulos do meio ...
Estudo da aplicação de redes neuronais artificiais para apoio à decisão na liberação do perfil lipídico e de glicemia em jejum.
(2011)
Resumo: As determinações do perfil lipídico (colesterol total, HDL-colesterol, LDL-colesterol, triglicérides) e da glicemia em jejum são ensaios de grande demanda nos laboratórios clínicos. A liberação destes resultados ...
Wedring : pipeline para análise de expressão diferencial em experimento de RNA-Seq
(2013)
Resumo: Transcriptoma e o conjunto completo de transcritos de uma célula em uma dada condição fisiológica e/ou de desenvolvimento. Atualmente, ha varias abordagens para se estudar o transcriptoma, tal como a tecnologia de ...
SILA
(2013)
Resumo: Na Bioinformática, a comparação de sequências é uma tarefa essencial para diversas atividades e é onde geralmente se tem o maior custo computacional. A anotação de genomas é uma atividade que envolve tarefas ...
Análise metagenômica de comunidades microbianas de solos do Paraná baseada no gene 16S rRNA
(2018)
Resumo: Metagenômica é o estudo das comunidades microbiológicas encontradas em um ambiente, combinando técnicas de extração de material genético, genômica e bioinformática. Através deste estudo, podemos acessar um microbioma ...
Desenvolvimento da ferramenta para finalização de montagens de genomas in silico - FGAP
(2014)
Resumo: A finalização é a etapa que consome mais tempo e demanda maior esforço em projetos de determinação de sequências genômicas. Diversos métodos computacionais (in silico) foram propostos com o objetivo de resolver ...
Identificação de Splicing alternativo em sítios de início de transcrição de mRNAS de arroz utilizando dados de RNA-Seq.
(2012)
Resumo: RNA-Seq é uma técnica que permite quantificar os níveis de expressão de uma forma muito mais precisa do que os métodos empregados anteriormente. Estudos que utilizaram esse método já alteraram a visão da extensão ...
Avaliação quantitativa de sistemas preditores de função de proteinas
(2013-05-21)
Resumo: Este trabalho propõe aprofundar as avaliações dos sistemas preditores de função de proteína que utilizam como dado de entrada a sequência de uma proteína, podendo na sua conclusão determinar qual a melhor estratégia ...
RNAs não codificadores regulatórios em bactérias do gênero Aeromonas
(2017)
Resumo: Bactérias do gênero Aeromonas são Gram-negativas com forma de bastonetes e que não formam esporos. São anaeróbias facultativas e quimiorganotróficas. Desde 1992 formam a nova família Aeromonadaceae, ordem Aeromonadales, ...