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Análise filogenética da região codificante do genoma plastidial : uma abordagem livre de alinhamento utilizando o algoritmo SVect
(2018)
Resumo: Com o advento do sequenciamento massivo paralelo de DNA, o campo da bioinformática tornou-se desafiador no que diz respeito a análises genômicas envolvendo Big Data. A filogenômica possui duas principais abordagens ...
Desenvolvimento de ProClaT, uma ferramenta computacional para a classificação de proteínas : o caso "DraB" de Azospirillum brasiliense
(2010)
Resumo: Azopirillum brasilense é uma bactéria fixadora de nitrogênio que promove o crescimento vegetal e é utilizada como bio-fertilizante na agricultura. Uma vez que o processo demanda um alto gasto de energia, a redução ...
Montagem genômica da bactéria endofítica diazotrófica Herbaspirillum rubrisubalbicans M1
(2012-10-10)
Resumo: Herbaspirillum rubrisubalbicans M1 é uma bactéria endofítica diazotrófica que causa a doença da estria mosqueada em algumas variedades suscetíveis de cana-deaçúcar. Nesse estudo, um total de 560.138 reads provenientes ...
JMSA : Java Mass Spectrometry Analyzer: ferramenta para gerenciamento e análise de banco de espectros de massa para identificação de microrganismos
(2017)
Resumo: A utilização da espectrometria de massa MALDI-TOF permite a identificação de microrganismos através da geração de espectros de massa, representando um perfil característico de sinais obtidos a partir de peptídeos ...
Análise comparativa das ferramentas de predição de ilhas genômicas
(2017)
Resumo: Ilhas genômicas são segmentos de DNA em organismos procariotos, que apresentam características que diferem das demais regiões do genoma. As principais características são: conteúdo GC% distinto do genoma; presença ...
Análise de ilhas genômicas a partir de clusterização de proteínas
(2021)
Resumo: A resistência antimicrobiana e reconhecida como uma das mais graves ameaças globais para a saúde humana no século 21. Um importante mecanismo na adaptação de microrganismos esta presente nas Ilhas Genômicas (GIs). ...
Bioinformática aplicada à unificação dos bancos de histocompatibilidade dos laboratórios de imunogenética do Hospital de Clínicas e Genética Molecular Humana da UFPR
(2012-04-09)
Resumo: O Laboratório de Imunogenética do Hospital das Clínicas (LIHC) da Universidade Federal do Paraná (UFPR) dispõe de um grande volume de dados de tipagens HLA de familiares de pacientes, que foram cadastrados em um ...
Montagem do draft genômico da bactéria Herbaspirillum hiltneri N3
(2012-11-22)
Resumo
PreProcSEQ : pipeline de controle de qualidade e pré-processamento de dados de RNA-Seq
(2022)
Resumo: O sequenciamento de RNA através de sequenciadores de nova geração é denominado de RNA-Se , este sequenciamento permite estimar a abundância de transcritos e a identificação de genes diferencialmente expressos entre ...
Montagem e anotação do genoma da bactéria endofítica diazotrófica Herbaspirillum rubrisubalbicans M4
(2016)
Resumo: Herbaspirillum rubrisubalbicans M4 é uma bactéria endofítica diazotrófica que provoca a doença da estria mosqueada em algumas variedades de cana-de-açúcar e sorgo. No presente estudo, um total de 4.101.514 reads ...