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Mapeamento de genes nif publicados no NCBI usando conceitos de mineração de dados e inteligência artificial
(2012-10-10)
Resumo: A Fixação Biológica de Nitrogênio é um importante processo biosustentável, aplicado na agricultura sob a forma de biofertilizantes. Na FBN ocorre a redução do dinitrigênio gasoso (N2) à amônia (NH4), mediante ...
Montagem genômica da bactéria endofítica diazotrófica Herbaspirillum rubrisubalbicans M1
(2012-10-10)
Resumo: Herbaspirillum rubrisubalbicans M1 é uma bactéria endofítica diazotrófica que causa a doença da estria mosqueada em algumas variedades suscetíveis de cana-deaçúcar. Nesse estudo, um total de 560.138 reads provenientes ...
Análise comparativa das ferramentas de predição de ilhas genômicas
(2017)
Resumo: Ilhas genômicas são segmentos de DNA em organismos procariotos, que apresentam características que diferem das demais regiões do genoma. As principais características são: conteúdo GC% distinto do genoma; presença ...
Banco de dados biológico no modelo relacional para mineração de dados em genomas completos de procariotos disponibilizados pelo NCBI GenBank
(2012-04-09)
Resumo: O NCBI GenBank, um dos três principais bancos de dados primários, tem centralizado as informações obtidas pelos processos de sequenciamento de DNA e/ou RNA e as tem distribuído no formato de arquivos textos. Nos ...
Wedring : pipeline para análise de expressão diferencial em experimento de RNA-Seq
(2013)
Resumo: Transcriptoma e o conjunto completo de transcritos de uma célula em uma dada condição fisiológica e/ou de desenvolvimento. Atualmente, ha varias abordagens para se estudar o transcriptoma, tal como a tecnologia de ...
Sila Eukaryotic : ferramenta para anotação automática de genes eucariotos
(2016)
Resumo: A marcação e anotação de genomas são processos essenciais e fundamentais presentes na Bioinformática, necessários para a análise de sequências de DNA. Geralmente essas atividades exigem muito tempo de processamento ...
Sequenciamento e análise do genoma de derxia lacustris HL 12
(2016)
Resumo: As rizobactérias são bactérias de vida livre que habitam as raízes das plantas, desenvolvem uma relação de simbiose e geram benefícios aos organismos vegetais. A existência desses organismos é de grande importância ...
Análise comparativa de genomas de isolados clínicos e ambientais do gênero Herbaspirillum
(2018)
Resumo: Bactérias do gênero Herbaspirillum, de origem ambiental, têm, recentemente, sido isoladas de amostras clínicas, em especial de pacientes imunocomprometidos. Para investigar como bactérias ambientais sobrevivem e ...
Web GAAT : a web tool for genome analysis and annotation
(2017)
Resumo: A grande quantidade de dados genômicos, obtidos através de sequenciadores automáticos de DNA de nova geração, os NGS, tem possibilitado o estudo de genomas em níveis inéditos. Embora existam diferentes programas ...