Clonagem e caracterizaçao de um gene que codifica uma nova GTPases em Trypanosoma cruzi

Abstract

Nós caracterizamos um gene do protozoário flagelado Trypanosoma cruzi, denominado de TcGBP, que codifica uma nova proteína que liga GTP. A região codificante do gene TcGBP tem 1.185 pb e codifica uma proteína de 44,3 kDa. A busca por homologia, usando o algoritmo BlastX, revelou que TcGBP compartilha alta similaridade com outras prováveis proteínas ligadoras de GTP em eucariotos, incluindo algumas espécies de tripanossomatídeos (Leishmania major e Trypanosoma brucei). Homologia menor, porém significativa foi também encontrada entre a seqüência predita da TcGBP e GTPases bacterianas da família YyaF/YchF. Características importantes do domínio G dessa família de GTPases são encontradas conservadas na TcGBP. Embora a função das GTPases YyaF/YchF seja desconhecida, outros membros dessa família têm função de fatores de tradução. Imunoblot de polissomos de T. cruzi, fracionados em gradiente de sacarose, mostra que a TcGBP está associada às subunidades ribossomais, sugerindo que TcGBP seja um novo fator de tradução em T. cruzi, relacionado a GTPase YchF bacteriana

We have characterized a gene of the flagellate protozoan Trypanosoma cruzi, named TcGBP that encodes a novel GTP binding protein. The coding region of TcGBP gene is 1,185 pb long and encodes a protein of 44.3 kDa. A search for homology using the BlastX algorithm showed that TcGBP shares high similirity with other putative GTP binding proteins from eukaryotes, including some species of trypanosomatids (Leishmania major and Trypanosoma brucei). A lower but significant homology is also found between the predicted sequence of the TcGBP and the bacterial YyaF/YchF GTPases. Important features of the G domain of this family of GTPases are found to be conserved in TcGBP. Although the function of YyaF/YchF GTPases is unknown, other members of this family have been found to function as translation factors. Immunoblot from the T. cruzi polysome fracctioning in sucrose gradient shows that TcGBP is associated to ribosomal subunits, suggesting that TcGBP is a novel translation factor of T. cruzi related to the bacterial YchF GTPase.