Estudos filogenéticos e genômicos no gênero Anathallis (Orchidaceae)

Abstract

Resumo: riqueza da família Orchidaceae com mais de 5 mil espécies, todas restritas à região neotropical. Apesar de seu monofiletismo estar bem estabelecido, a circunscrição de seus gêneros ainda é muito debatida, como ocorre com Anathallis. Porém, os trabalhos filogenéticos desenvolvidos até então utilizaram uma amostragem ineficiente e exploraram poucos conjuntos de dados, basicamente o sequenciamento da região nrITS, estabelecendo relações taxonômicas duvidosas entre as espécies de Anathallis e os demais gêneros do grupo. Além disso, não foram realizados estudos genômicos focados na subtribo, indicando uma profunda lacuna de conhecimento acerca da biologia molecular desse grupo de orquídeas. Este trabalho foi desenvolvido em dois capítulos, sendo que no primeiro foram realizadas análises filogenéticas e de datação molecular utilizando uma amostragem mais robusta do gênero Anathallis e valendo-se do sequenciamento de seis regiões moleculares, incluindo a nrITS. Também foram codificados caracteres morfológicos, incorporados em análises filogenéticas conjuntas e de reconstrução de caracteres morfológicos. No segundo capítulo é apresentada a sequência completa do genoma cloroplastidial de Anathallis obovata, espécie-tipo do gênero, que foi comparada com sequências genômicas de táxons próximos das subtribos Pleurothallidinae e Laeliinae. Palavras-chave: Pleurothallidinae; genoma cloroplastidial; orquídeas neotropicais; datação molecular; filogenia de evidência total.

Abstract: The subtribe Pleurothallidinae (Epidendroideae: Epidendrae) represents 20% of the species richness of Orchidaceae with more than 5 thousand species, all restricted to the neotropical region. Although its monophyletism is well established, the circumscription of its genera is still much debated, as is the case of Anathallis. Previous phylogenetic studies used inefficient sampling and explored few data sets, basically the sequencing of the nrITS region, establishing dubious taxonomic relationships between Anathallis species and the other genera of Pleurothallidinae. In addition, there are no Pleurothallidinae-focused genomic studies, indicating a lack of knowledge about the molecular biology of this orchid group. This work was developed in two chapters. In the first one, phylogenetic and molecular dating analyses were performed using a larger sample of the genus Anathallis and using the sequencing of six molecular regions, including the nrITS. Morphological characters were also coded, used in concatenated phylogenetic and morphological characters reconstruction analysis. In the second chapter we present the complete sequence of the chloroplast genome of Anathallis obovata, the type-species of the genus, which was compared with genomic sequences of closely-related taxa of the subtribe Pleurothallidinae and also of subtribe Laeliinae. Keywords: Pleurothallidinae; chloroplast genome; neotropic orchids; molecular dating; total evidence phylogeny.