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dc.contributor.authorTieppo, Eduardopt_BR
dc.contributor.otherSouza, Emanuel Maltempi de, 1964-pt_BR
dc.contributor.otherOliveira, Lucas Ferrari dept_BR
dc.contributor.otherUniversidade Federal do Paraná. Setor de Educação Profissional e Tecnológica. Programa de Pós-Graduação em Bioinformáticapt_BR
dc.date.accessioned2012-10-10T17:08:45Z
dc.date.available2012-10-10T17:08:45Z
dc.date.issued2012-10-10
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/1884/25639
dc.description.abstractResumo: A fixação biológica de nitrogênio é um processo essencial para a vida na Terra e é realizada apenas por procariotos. Entre os fixadores de nitrogênio, as bactérias da ordem Rhizobiales são capazes de formar simbiose com leguminosas utilizadas na alimentação humana e animal, como soja e feijão. Nesta associação, a bactéria sofre diferenciação para uma forma bacterióide e ocupa um órgão específico, chamado de nódulo, onde ocorre a fixação de nitrogênio fornecendo os nutrientes necessários à planta. Em termos econômicos, associação de soja e Bradyrhizobium é a mais importante deste tipo de simbiose, representando uma economia estimada para os agricultores brasileiros de cerca de 1,7 bilhão de dólares por ano. Neste estudo, foi obtida a sequência preliminar do genoma de Bradyrhizobium elkanii estirpe 587, utilizada como inoculante para soja no Brasil. Cerca de 6 milhões de leituras Illumina-Solexa, representando uma profundidade de cobertura entre 28x e 32x, foram montadas usando o montador Velvet. Além disso, aproximadamente 40 mil leituras Sanger (profundidade de cobertura entre 4x e 5x) foram montadas com o montador Phrap. Os scaffolds produzidos pelo montador Velvet foram alinhados utilizando o programa MUMmer e o genoma de Bradyrhizobium japonicum USDA 110 como referência. Finalmente, as falhas foram fechadas manualmente utilizando Consed. Palavras-pt_BR
dc.format.mimetypeapplication/pdfpt_BR
dc.languagePortuguêspt_BR
dc.subjectTesespt_BR
dc.subjectGenômicapt_BR
dc.subjectNitrogenio - Fixaçãopt_BR
dc.subjectDNApt_BR
dc.subjectMapeamento geneticopt_BR
dc.subjectBradyrhizobiumpt_BR
dc.subjectBioinformáticapt_BR
dc.titleMontagem e análise preliminar do genoma de Bradyrhizobium elkanii 587 utilizando leituras de sequências de DNA curtaspt_BR
dc.typeDissertaçãopt_BR


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