Análise de microssatélites da regiao MHC em uma amostra de doadores voluntários de medula óssea

Abstract

Resumo: Microssatélites são seqüências de DNA com repetições curtas, de 1 a 6 pares de bases, que ocorrem em tandem e estão distribuídas por todo o genoma. Podem apresentar um alto grau de polimorfismo e há grande evidência na literatura de que muitos deles sejam bons marcadores genéticos. Neste trabalho, foram investigados 7 microssatélites da região MHC em uma amostra composta por indivíduos caucasóides da cidade de Curitiba e região metropolitana. Foram descritas as freqüências alélicas, genotípicas e haplotípicas dos microssatélites assim como o desequilíbrio de ligação entre os alelos destes marcadores e os alelos ou grupos alélicos dos genes HLA-B, HLA-DRB1 e HLA-DQB1. Os microssatélites mais polimórficos foram encontrados próximos ao gene HLA-B, na região MHC de classe I, sugerindo uma evolução mais rápida desta região. A comparação com outros estudos populacionais demostrou diferenças nas freqüências alélicas, as quais podem ser devidas ao longo tempo de divergência entre essas populações, juntamente com a ação da deriva genética. Além disso, a comparação entre as freqüências alélicas possibilitou a inferência de fluxo gênico entre populações euro-brasileiras e populações indígenas. Os resultados indicam a existência de desequílibrio de ligação entre alelos de microssatélites e alelos ou grupos alélicos dos genes HLA. O desequilíbrio de ligação foi mais fortemente observado nas proximidades dos genes HLA clássicos. Os resultados deste estudo trazem informações a respeito de haplótipos HLA, podendo ser úteis para a prática laboratorial.

Microsatellites are short tandem repeats of 1-6bp DNA fragments, which are found all over the genome. Many of them are highly polymorphic and may be good markers for genetic studies. In this study, we investigated 7 microsatellites of the MHC region in a sample composed of Caucasoid individuals from the region of Curitiba and surrounding districts. Allelic, genotypic and haplotypic frequencies are described as well as the linkage disequilibrium between alleles of these microsatellites and alleles of the HLA genes: HLA-B, HLA-DRB1 and HLA-DQB1. The most polymorphic microsatellites were found close to HLA-B gene, in the MHC class I region, suggesting that this region may be subject to a faster pace of evolution. Comparisons with other population studies showed differences in the allelic frequencies, which may be due to the long time of divergence between these groups, associated with the effect of genetic drift. Moreover, the comparison of the allelic frequencies suggested possible gene flow between Euro-Brazilian populations and Amerindians. Strong linkage disequilibrium was observed between alleles of microsatellites and HLA genes, specially in the vicinity of classic HLA genes. This study contributes with important information on HLA haplotypes, which may be useful in laboratory routine.