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<title>Teses</title>
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<id>https://hdl.handle.net/1884/39638</id>
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<title>Estudo demográfico, antropológico e genético das populaçoes da Costa da Lagoa e de Sao Joao do Rio Vermelho, na Ilha de Santa Catarina</title>
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<updated>2026-01-26T15:41:38Z</updated>
<published>2001-01-01T00:00:00Z</published>
<summary type="text">Estudo demográfico, antropológico e genético das populaçoes da Costa da Lagoa e de Sao Joao do Rio Vermelho, na Ilha de Santa Catarina
Resumo: As comunidades da Costa da Lagoa (CLG) e de São João do Rio Vermelho (SJRV), na Ilha de Santa Catarina, são conhecidas por descender de imigrantes do arquipélago dos Açores, com uma menor contribuição de africanos sub-saarianos e ameríndios. A colonização da ilha por não ameríndios começou durante o século XVffl. Desde então, uniões entre pessoas de diferentes origens vêm ocorrendo. Durante muitas décadas, SJRV e CLG permaneceram isoladas das comunidades vizinhas. Depois de 1970, SJRV começou a receber imigrantes e muitos de seus habitantes saíram para as vilas próximas, enquanto CLG continuou parcialmente isolada. Os objetivos deste estudo foram analisar a estrutura populacional, a diversidade genética e estimar a contribuição relativa dos diferentes grupos étnicos para o atual "pool gênico" das duas comunidades. Marcadores genéticos das hemácias do sangue e das proteínas séricas foram tipados por métodos convencionais. PCR-SSCA foi usado para identificar os genótipos HLA-DRA e PCR-SSOP para os outros genes HLA (DRB1, DRB3, DRB5, DQA1, DQB1) nas amostras das duas populações (SJRV, n»150; CLG, n*120). Freqüências alélicas (fa), genotípicas (fg) e haplotípicas (fli) foram estimadas por métodos padronizados. Os valores de mistura foram estimados pelo método de quadrado médio, utilizando-se as freqüências alélicas dos locos ABO, RHD, RHCE, GPA, GPB, HBB, HP, TF, CP, AK1, ACPI e DRB1. A maior diversidade em SJRV está de acordo com a história recente e a estrutura da população, uma vez que os haplótipos mais freqüentes nestas comunidades também o são em Europeus (os mais freqüentes são DRA *0101-DRB1 *0701-DQA1*0201-DQB1 *0201, fh=0,163 na CLG e 0,117 em SJRV, junto com DRA*0102-DRB1 *1501-DRB5*0101-DQA1*0102-DQB1 *0602). Haplótipos tipicamente africanos (DRB1*1503-DQA1 *0102-DQB1*0602 e DRB1*03021-DQA1*0401- DQB1*0402), caucasóides (DRB1 *0801-DQA1 *0401-DQB1*0402) e ameríndios (DRB1*16021- DQA1 *0501-DQB1 *0301; DRB1*0807-DQA1*0401-DQB1*0402 ou DRB 1*0411-DQA 1*0401- DQB1 *0402) foram vistos em ambas as populações. SJRV tem recebido mais imigrantes durante a última geração enquanto o endocruzamento na CLG ainda é alto (F=500xl0's). Dados revelam uma constituição triíbrida para SJRV e CLG. Os componentes étnicos das populações estudadas podem ser quantificados como segue: para CLG, 18,9% de africanos sub-saarianos (A), 77,9% de europeus iberos (P) e 3,2% de sul ameríndios (I); para SJRV, A=33,4%, P=57,4% e 1=9,2%. Devido às freqüências alélicas do loco GPB, em SJRV, terem sido incomuns, provavelmente em conseqüência da deriva genética, os valores de mistura foram recalculados após exclusão de GPB, ficando: A=10,2%; P=73,9% e 1=15,9%. A diversidade total (HT) foi estimada como 50,58%, dos quais 99,6% podem ser atribuídos à variabilidade intra-populacional (Hs). A variação genética inter-populacional (ou distância padrão, Dst) corresponde a 0,21%, enquanto o coeficiente de diferenciação gênica é 0,32%, indicativo de baixa diferença genética. Os resultados levam a concluir que a deriva genética pode ter tido um efeito importante na CLG, enquanto o fluxo gênico poderia ser o fator evolutivo atualmente predominante, potencialmente capaz de alterar as freqüências alélicas em SJRV. Embora tenha ocorrido alguma diferenciação entre as duas comunidades (Da= 0,168 em relação a 23 alelos DRBI), a distância genética de Nei, considerando 10 locos (sistemas sangüíneos eritrocitários, protéicos e enzimáticos; Da= 0,012) mostrou-as relativamente próximas; Abstract:The Costa da Lagoa (CLG) and São João do Rio Vermelho (SJRV) communities, in the Island of Santa Catarina, are known to descendent of immigrants from the Azores Archipelago, with a minor contribution of sub-Saharan Africans and of Amerindians. Settlement of the Island by non-Amerindians began during the 18* century. Since then, intermarriage between people of dififerent origins has been occurring. During many decades, SJRV and of CLG remained isolated from neighboring communities. After 1970, SJRV started to receive immigrants and many of its inhabitants emigrated to neighboring villages, while CLG continued partially isolated. The objectives of this study were to analyze the population structure, the genetic diversity and to estimate the relative contribution of the dififerent ethnic groups to the current gene pool of the two communities. Blood red cell and serum protein genetic markers were typed through conventional methods. PCR-SSCA was used to identify HLA-DRA genotypes and PCR-SSOP for the other HLA genes (DRB1, DRB3, DRB5, DQA1, DQB1) in the two population samples (SJRV, n«150; CLG, n«120). Allele (af), genotype (gf) and haplotype frequencies (hf) were estimated by standard methods. The values of admixture were obtained by the weighted least-squares method based on the allelic frequencies of the loci ABO, RHD, RUCE, GPA, GPB, HBB, HP, TF, CP, AK1, ACPI and DRB1. Higher diversity in SJRV is in accordance with recent history and population structure, since haplotypes presenting highest frequencies in these communities are common in Europeans (the most frequent are DRA*0101-DRB1*0701-DQA1*0201-DQB1*0201, hfN).163 in CLG and 0.117 in SJRV, together with the DRA*0102-DRB1*1501-DRB5*0101-DQA1*0102-DQB1 *0602). Typically African (DRB1*1503-DQA1 *0I02-DQB1 *0602 and DRB1 *03021-DQA1 *0401-DQB1 *0402), Caucasoid (DRB1 *0801-DQA1 *0401-DQB1 *0402) and Amerindian (DRB1*16021-DQA1*0501-DQB1*0301; DRB1*0807-DQA1 *0401-DQB1*0402 or DRB1 *0411-DQA1 *0401-DQB1*0402) haplotypes were seen in both populations. SJRV received more immigrants during the last generation, while inbreeding in CLG is still high (F = 500xl0'5). Data reveal a trihybrid constitution of SJRVs and CLG’s populations. The origins of the studied populations can be quantified as follows: for CLG, sub-Saharan Africans (A)=18.9%, Iberian Europeans (P)=77.9% and Southern Amerindians (I)=3.2%; for SJRV, A=33.4%, P=57.4% and 1=9.2%. Because allele frequencies of the GPB locus in SJRV were unusual, possibly as a consequence of random genetic drift, the values of admixture were recalculated after exclusion of GPB: A=10.2%; P=73.9% and 1=15.9%. The total diversity (HT) was estimated as 50.58%, of which 99.6% can be attributed to the intra-populational variability (Hs). The inter-populational genetic variation (or standard distance, Dst) corresponds to 0.21%, while the gene diflferentiation coefiBcient is 0.32%, indicative of low genetic difiference. The results led to the conclusion that random genetic drift may have an important effect in CLG, while presently gene flow might be the predominant evolutionary fàctor potentially changing allele frequencies in SJRV. Although there is some diversification of the two communities (Da= 0.168 based on 23 DRB! alleles), Nei’s genetic distance based on 10 loci (Da=0.012) showed them to still be closely related
Orientadora: Maria Luiza Petzl-Erler; Tese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciencias Biológicas
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<dc:date>2001-01-01T00:00:00Z</dc:date>
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<title>Avaliação do uso de alternativas metodológicas no processo de ensino-aprendizagem de genética no ensino médio e o desenvolvimento de ferramentas de educação científica</title>
<link href="https://hdl.handle.net/1884/100183" rel="alternate"/>
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<id>https://hdl.handle.net/1884/100183</id>
<updated>2026-01-13T16:00:11Z</updated>
<published>2020-01-01T00:00:00Z</published>
<summary type="text">Avaliação do uso de alternativas metodológicas no processo de ensino-aprendizagem de genética no ensino médio e o desenvolvimento de ferramentas de educação científica
Resumo: A preocupação com os impactos antrópicos causados ao ambiente e aos seres vivos faz necessário estudos toxicológicos de diferentes xenobióticos, em especial contaminantes emergentes, como as nanopartículas (NPs). As NPs tem sido amplamente utilizadas sem um real conhecimento dos seus efeitos nocivos. Apesar de estudos toxicológicos de NPs já serem encontrados na literatura, muitos são inconclusivos quanto a real periculosidade destes agentes, devido à alta instabilidade de suas propriedades físico-químicas e uma incerteza quanto a biodisponibilidade das NPs aos sistemas teste biológicos. Diferentes modelos biológicos tem sido empregados na Toxicologia, dentre eles, as plantas são importantes organismos para compreender impactos ambientais. Frente ao exposto, o presente trabalho teve como objetivo avaliar o potencial de indução de danos no DNA e alterações morfológicas de NPs de dióxido de titânio (NPTiO2) por meio do sistema teste de Allium cepa. Além disso, para garantir uma precisa estimativa dos efeitos nocivos destas NPs, este trabalho também avaliou diferentes metodologias de exposição, buscando garantir a biodisponibilidade destas NPs para A. cepa. A comparação dos diferentes protocolos de exposição do teste de A. cepa (sementes germinadas em placas de Petri de poliestireno com papel filtro ou rede de nylon e bulbos dispostos em tubos de poliestireno), mostrou que não houve diferença entre os protocolos com sementes quanto a genotoxicidade das NPTiO2 observada. Tal resultado sugere que não houve interferência destes dois protocolos na biodisponibilidade das NPs. No entanto, uma diferença significativa foi observada entre os protocolos com semente e bulbos, porém, este resultado está relacionado com a maior sensibilidade das sementes a detecção de xenobióticos já demonstrada na literatura. Desta forma, o protocolo utilizando sementes e rede de nylon foi adotado para a avaliação genotoxicológica e de alterações morfológicas das NPTiO2 em A. cepa. Foram evidenciadas redução do Índice Mitótico (IM) e aumento nas frequências de aberrações cromossômicas (AC) e micronúcleo (MN) nas células meristemáticas de A. cepa expostas as NPTiO2 de maneira concentração-dependente. Estes resultados mostram a periculosidade das NPTiO2 quanto a sua ação de citotóxica e a capacidade de indução de danos, por um modo de ação clastogênico para este sistema vegetal. Além disso, a análise morfológica evidenciou uma maior condensação da cromatina, um aumento no número de vacúolos, sendo estes mais volumosos que o controle negativo e uma grande quantidade de corpos de óleos com localização adjacente a membrana plasmática. Tais resultados apontam para um mecanismo de defesa celular contra a entrada das NPs na tentativa de minimizar os efeitos deletérios por elas causados. A avaliação genotoxicológica e morfológica realizada neste trabalho, nos permite concluir que as NPTiO2 causam efeitos adversos nestes organismos, sendo real a preocupação com seus efeitos.; Abstract: Concern about the anthropogenic impacts on the environment and living beings is necessary toxicological studies of different xenobiotics, especially emerging contaminants, such as nanoparticles (NPs). NPs have been widely used without a real knowledge of its harmful effects. Although toxicological studies of NPs already be found in the literature, many are inconclusive as the real danger of these agents due to the high instability of its physicochemical properties and uncertainty about the bioavailability of NPs to biological test systems. Different biological models have been used in toxicology, among them, the plants are important organisms for understanding environmental impacts. Based on these, this study aimed to evaluate the potential damage induction in DNA and morphological changes of titanium dioxide NPs (NPTiO2) through the Allium cepa test system. In addition, to ensure precise estimate of the harmful effects of these NPs, this study also evaluated different methods of exposure, seeking to ensure the bioavailability of these NPs to A. cepa Comparison of different protocols exposure of A. cepa test (germinated seeds in polystyrene Petri dishes with filter paper or nylon net and bulbs arranged in polystyrene tubes), showed no difference between the protocols with seeds as genotoxicity of NPTiO2 observed. This result suggests that there was no interference of two protocols on the bioavailability of NPs. However, a significant among the protocols and seed bulbs, however, this result is related to the higher sensitivity difference was observed of detection seeds xenobiotics been demonstrated in the literature. Thus, using the protocol seeds and nylon net it was evaluated genotoxicologic and morphologic changes in the NPTiO2 A. cepa. Were evidenced reduction in the mitotic index (MI) and an increase in the frequency of chromosome aberrations (CA) and micronuclei (MN) in the meristematic cells of A. cepa the exposed so NPTiO2 concentration-dependent. These results show the dangerousness of NPTiO2 as their cytotoxic action and inducing ability damage, for clastogenic action mode in plant systems. Furthermore, the morphological analysis showed greater chromatin condensation, an increase in the number of vacuoles, which are more bulky than the negative control and a large amount of oil bodies located adjacent to the plasma membrane. These results point to a cellular defense mechanism against the entry of NPs in an attempt to minimize the deleterious effects caused by them. The genotoxicologic and morphological evaluation performed in this work shows that the NPTiO2 cause the adverse effects on organisms, with real concern for its effects.
Orientadora: Profa. Dra. Daniela Morais Leme; Coorientadora: Profa. Dra. Lupe Furtado Alle; Tese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Genética. Defesa : Curitiba, 30/03/2020; Inclui referências: p. 138-145
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<title>Análise genômica de isolados endofíticos Bacillus velezensis e Stenotrophomonas geniculata promotores de crescimento em milho e sob stress salino</title>
<link href="https://hdl.handle.net/1884/100113" rel="alternate"/>
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<id>https://hdl.handle.net/1884/100113</id>
<updated>2026-01-09T19:12:00Z</updated>
<published>2024-01-01T00:00:00Z</published>
<summary type="text">Análise genômica de isolados endofíticos Bacillus velezensis e Stenotrophomonas geniculata promotores de crescimento em milho e sob stress salino
Resumo: Bactérias endofíticas podem se associar a hospedeiros vegetais proporcionando benefícios a ambos, como promoção do crescimento vegetal (PGP), maior resistência a patógenos, e em relação a fatores abióticos, aumento a estresses salinos e hídricos. O excesso de sais no solo desencadeia vários distúrbios fisiológicos nas plantas, afetando o rendimento produtivo das culturas. A exploração da relação planta-microrganismo vem sendo cada vez mais importante para diversas culturas de relevância agronômica, como o milho e pode reduzir o uso de fertilizantes e agroquímicos, gerando uma agricultura mais sustentável. O objetivo principal desse trabalho foi avaliar a capacidade de três isolados de Bacillus velezensis LGMB12, LGMB319 e LGMB426 e um isolado de Stenotrophomonas geniculata LGMB417 em contribuir diretamente e/ou indiretamente para o crescimento de plantas de milho. Esses isolados foram identificados por meio de análise multilocus de inferência Bayesiana usando os genes 16S rRNA, gyrA, recA e rpoB. Treze condições de inoculação foram testadas em dois experimentos em casa de vegetação incluindo controles, inoculação de cada isolado separadamente e nos seis pares de combinações duas a duas. No primeiro experimento foi avaliada promoção de crescimento vegetal e no segundo a tolerância à salinidade, utilizando NaCl 75 e 100 mM na água de irrigação. Cada experimento foi realizado com 10 e 8 repetições em cada tratamento, respectivamente. A capacidade de antagonismo contra fungos patogênicos de milho foi avaliada com os isolados de B. velezensis por meio da técnica de cultura pareada com Fusarium graminearum, F. verticillioides, Colletotrichum graminicola e Stenocarpella sp. Os genomas completos dos quatro isolados bacterianos foram analisados visando identificar genes relacionados com a promoção do crescimento e proteção de plantas. Os resultados revelaram que a co-inoculação produziu os melhores resultados para o crescimento vegetal, destacando os efeitos sinérgicos da combinação dos isolados B. velezensis e S. geniculata como estratégia para aumentar o crescimento e melhorar a tolerância à salinidade no cultivo de milho. Nos testes de antagonismo em culturas pareadas todos os tratamentos com B. velezensis exibiram diferenças estatisticamente significativas em comparação aos tratamentos negativos e positivos. A montagem do genoma revelou que os isolados de B. velezensis exibem tamanhos de genoma em média de 4.135 kb, já S. geniculata de 4.654 kb. Seu respectivo conteúdo G + C é em média 46,48 % e 66,50 %, respectivamente. As sequências abrangentes dos genomas revelaram a presença de múltiplos agrupamentos de genes responsáveis pela síntese de metabólitos secundários e enzimas ativas em carboidratos (CAZymes). Esses clusters de B. velezensis destacam uma gama diversificada de propriedades antimicrobianas. Complementado por genes relacionados à PGP encontrados nos genomas, incluindo aqueles associados ao transporte e solubilização de fosfato, metabolismo do nitrogênio, produção de sideróforos e transporte de ferro, modulação hormonal, respostas ao estresse (seca, flutuações de temperatura, desafios osmóticos e oxidação condições ambientais) e compostos orgânicos voláteis (COV). Os resultados promissores obtidos neste trabalho indicam que desses isolados poderão ser utilizados como bioinsumos em ambientes agrícolas, após experimentos à campo. Estudos subsequentes também poderão abranger metodologias de expressão gênica.; Abstract: Endophytic bacteria can associate with plant hosts providing benefits to both, such as plant growth promotion (PGP), increased resistance to pathogens, and in terms of abiotic factors, enhanced tolerance to saline and water stresses. Excessive salts in the soil trigger various physiological disturbances in plants, affecting the productive yield of crops. The exploration of the plant-microorganism relationship has become increasingly important for several agronomically relevant crops, such as maize, and can reduce the use of fertilizers and agrochemicals, promoting more sustainable agriculture. The main objective of this study was to evaluate the capacity of three isolates of Bacillus velezensis LGMB12, LGMB319, and LGMB426, and one isolate of Stenotrophomonas geniculata LGMB417 to directly and/or indirectly contribute to the growth of maize plants. These isolates were identified through multilocus analysis of Bayesian inference using the 16S rRNA, gyrA, recA, and rpoB genes. Thirteen inoculation conditions were tested in two greenhouse experiments including controls, inoculation of each isolate separately, and in six pairs of two-by-two combinations. In the first experiment, plant growth promotion was evaluated, and in the second, salinity tolerance was assessed using NaCl at 75 and 100 mM in the irrigation water. Each experiment was conducted with 10 and 8 replicates per treatment, respectively. The antagonistic capacity against corn pathogenic fungi was evaluated with the B. velezensis isolates using the paired culture technique with Fusarium graminearum, F. verticillioides, Colletotrichum graminicola, and Stenocarpella sp. The complete genomes of the four bacterial isolates were analyzed to identify genes related to plant growth promotion and protection. The results revealed that co-inoculation produced the best results for plant growth, highlighting the synergistic effects of the combination of B. velezensis and S. geniculata isolates as a strategy to increase growth and improve salinity tolerance in maize cultivation. In the antagonism tests in paired cultures, all treatments with B. velezensis showed statistically significant differences compared to negative and positive controls. Genome assembly revealed that the B. velezensis isolates exhibit average genome sizes of 4,135 kb, while S. geniculata has 4,654 kb. Their respective G + C content averages 46.48 % and 66.50 %, respectively. Comprehensive genome sequences revealed the presence of multiple clusters of genes responsible for secondary metabolite synthesis and carbohydrate-active enzymes (CAZymes). These B. velezensis clusters highlight a diverse range of animicrobial properties. Complemented by PGP-related genes found in the genomes, including those associated with phosphate transport and solubilization, nitrogen metabolism, siderophore production and iron transport, hormonal modulation, stress responses (drought, temperature fluctuations, osmotic challenges, and oxidative environmental conditions), and volatile organic compounds (VOC). The promising results obtained in this study indicate that these isolates could be used as bioinputs in agricultural environmental, following field experiments. Subsequent studies could also encompass gene expression methodologies.
Orientadora: Profa. Dra. Lygia Vitória Galli; Coorientadora: Profa. Dra. Vanessa Merlo Kava; Tese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Genética. Defesa : Curitiba, 19/03/2024; Inclui referências; Área de concentração:
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<dc:date>2024-01-01T00:00:00Z</dc:date>
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<title>O polimorfismo dos genes Kir em populações brasileiras e na doença autoimune Pênfigo Foliáceo</title>
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<id>https://hdl.handle.net/1884/49401</id>
<updated>2025-11-27T13:04:31Z</updated>
<published>2012-01-01T00:00:00Z</published>
<summary type="text">O polimorfismo dos genes Kir em populações brasileiras e na doença autoimune Pênfigo Foliáceo
Resumo: A família KIR apresenta grande diversidade e reconhece os antígenos leucocitários humanos (HLA) de classe I; poucas populações brasileiras foram estudadas. O objetivo desse estudo foi caracterizar a diversidade KIR em populações brasileiras e comparar com outras populações já descritas, analisando os variantes KIR no contexto de seus ligantes HLA. Nós estudamos o polimorfismo de ausência e presença de todos os genes de KIR e também a diversidade alélica de KIR3DL2, verificamos se esses genes interferem na susceptibilidade ao pênfigo foliáceo (PF), uma doença autoimune bolhosa da pele. A população de Curitiba apresentou frequências similares a populações européias e euro-descendentes, mas por ser miscigenada, mostrou uma maior diversidade de perfis genéticos. Os genes HLA-A e -B parecem ser igualmente importantes para o reconhecimento KIR. Nossos resultados acerca dos ligantes e receptores foram compatíveis com baixa ou ausência de força seletiva favorecendo combinações KIR-HLA. Os genes ativadores parecem exercer um efeito redundante (sobreposto) na susceptibilidade ao PF e a presença de mais de três genes ativadores foi protetora (OR=0.49, P=0.003). Associação protetora foi encontrada para maiores razões ativadores/inibidores (OR=0.44, P=0.001). KIR3DS1 e o epítopo HLA-Bw4 foram negativamente associados ao PF, tanto isoladamente quanto combinados, mas o efeito protetor foi maior para a presença dos dois (OR = 0.22, P&lt;10-3), sugerindo que a função ativadora de KIR é o principal fator interferindo na patogênese de PF. A frequência de indivíduos que apresentaram o alelo KIR3DL2*001 foi maior em pacientes (OR=1.9, P=0.01). Nós analisamos os polimorfismos de nucleotídeo único na região codificadora de KIR3DL2 e o alelo 1190T foi associado à proteção (OR=0.53, P=0.025). Grande diversidade alélica de KIR3DL2 foi observada em populações urbanas, em concordância com origem a partir de mistura de europeus, africanos, indígenas, asiáticos e mediterrâneos ao longo dos últimos séculos. Baixa diversidade alélica foi encontrada nos indígenas provavelmente devido ao efeito de gargalo populacional que eles sofreram no processo de migração para a América. Dezesseis novos alelos foram encontrados. Ainda há pouca informação sobre os alelos de KIR para a maioria das populações mundiais. Conhecer essa diversidade é crucial para compreendermos como a variabilidade desses genes interfere nas respostas imunes normais e nas doenças.; Abstract: The KIR gene family exhibits extensive diversity and interacts with the highly polymorphic human leukocyte antigens (HLA) class I; few Brazilian populations have been described so far. This study aimed to characterize the KIR diversity in Brazilian populations, to compare with other populations described and to analyze KIR variants in the context of their relationship with their known HLA class I (-A, -B and -C) ligands. We studied both presence/absence polymorphism of all KIR genes and also the allelic diversity of KIR3DL2 and we also investigated if the KIR polymorphism influences the susceptibility to pemphigus foliaceus (PF), an autoimmune blistering disease of the skin. The Curitiba's population was similar to European and Euro-descendant populations, but as an admixed population, showed more diversity of profiles. The HLA-A and -B genes appear to be equally important for NK cell function and our result of ligands and receptors was compatible with low or absent selection pressure favoring certain KIR-HLA combinations. The activating KIR genes may exert an overlapping effect on PF susceptibility and the presence of more than three activating genes was protective (OR = 0.49, p = 0.003). A significant protective association was found for higher ratios of activating to inhibitory KIR (OR=0.44, p=0.001). KIR3DS1 and the HLA-Bw4 epitope were negatively associated to PF either isolated or combined, but an increased protective effect was found for the presence of both (OR = 0.22, p&lt;10-3) suggesting that the activating function is the major factor interfering in the PF pathogenesis. The frequency of individuals with the KIR3DL2*001 allele was increased in patients (OR = 1.9, p = 0.01). We looked at the informative single nucleotide polymorphisms in the sequenced coding region of KIR3DL2 and the allele 1190T was associated to a lower risk (OR = 0.53, p = 0.025). High allelic diversity of KIR3DL2 was observed in our urban populations, in agreement with the history of the Brazilian population that was formed by European, African, Amerindian, eastern Asian and Middle Eastern admixture over the last few centuries. Low allelic diversity was found in Amerindians when compared to urban populations, as expected considering the founder effect that the Amerindians may have suffered during the migration to America. Sixteen new alleles were found. Allelic information is still lacking in most of the KIR studies and for the majority of the populations worldwide. Yet, this knowledge is crucial to comprehend the role that the variability of these genes plays in health and in disease.
Orientadora : Profa. Dra. Maria Luiza Petzl-Erler; Tese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Genética. Defesa: Curitiba, 29/02/2012; Bibliografia: fls. 132-139
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<dc:date>2012-01-01T00:00:00Z</dc:date>
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