Estratégias moleculares para a diferenciação de bactérias de origem ambiental

Abstract

Resumo : A caracterização de bactérias em nível de espécie é um desafio para os microbiologistas, pois muitos gêneros bacterianos possuem propriedades morfológicas e bioquímicas semelhantes entre espécies do mesmo gênero ou até mesmo entre diferentes gêneros. Técnicas de biologia molecular estão sendo cada vez mais utilizadas em laboratórios de microbiologia, não com o intuito de substituir as análises microbiológicas convencionais, mas como ferramentas auxiliares nos casos em que um microrganismo é de difícil caracterização, de difícil cultivo ou mesmo pela necessidade de agilidade em fechar um diagnóstico. O objetivo desse trabalho foi utilizar técnicas de biologia molecular para a caracterização de duas espécies de enterobactérias e duas espécies de Staphylococcus. Todas as bactérias foram isoladas do ambiente, sendo as enterobactérias isoladas de cama de aviário e as espécies de Staphylococcus, de biodiesel. Após o isolamento em meio de cultura específico, o DNA das bactérias foi extraído e submetido às análises moleculares. As duas amostras de enterobactérias foram submetidas à amplificação, pela Reação em Cadeia da Polimerase (PCR), utilizando iniciadores espécie específicos e sequenciamento da região rDNA 16S e o DNA dos dois isolados de Staphylococcus spp. foram submetidos à reação de sequenciamento da região rDNA 16S e análise por RFLP (Restriction Fragment Lenght Polymorphisms) da região do gene da catalase, utilizando a enzima de restrição AluI. As análises permitiram identificar duas espécies de enterobactérias (Klebsiella pneumoniae e Enterobacter cloacae) e duas espécies Staphylococcus (S. warneri e S. pasteuri). A caracterização destes isolados bacterianos em nível de espécie contribuirá com a continuação das pesquisas destes isolados em experimentos em andamento e futuros, visando a utilização destas bactérias em pesquisas com biohidrogênio e biodiesel, de grupos de pesquisadores da UFPR-Setor Palotina.