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(20--)Resumo: Metagenômica é o estudo das comunidades microbiológicas encontradas em um ambiente, combinando técnicas de extração de material genético, genômica e bioinformática. Através deste estudo, podemos acessar um microbioma ... -
Desenvolvimento de ProClaT, uma ferramenta computacional para a classificação de proteínas : o caso "DraB" de Azospirillum brasiliense
(2010)Resumo: Azopirillum brasilense é uma bactéria fixadora de nitrogênio que promove o crescimento vegetal e é utilizada como bio-fertilizante na agricultura. Uma vez que o processo demanda um alto gasto de energia, a redução ... -
Desenvolvimento e validação de sistema de apoio à decisão em urinálise com inteligência artificial utilizando redes neuronais
(2011)Resumo: A urinálise contempla uma avaliação semi-quantitativa de analitos e contagem diferencial de células presentes na urina. A análise fornece informações diagnósticas relevantes principalmente sobre o sistema urinário ... -
Estudo da aplicação de redes neuronais artificiais para apoio à decisão na liberação do perfil lipídico e de glicemia em jejum.
(2011)Resumo: As determinações do perfil lipídico (colesterol total, HDL-colesterol, LDL-colesterol, triglicérides) e da glicemia em jejum são ensaios de grande demanda nos laboratórios clínicos. A liberação destes resultados ... -
Identificação de Splicing alternativo em sítios de início de transcrição de mRNAS de arroz utilizando dados de RNA-Seq.
(2012)Resumo: RNA-Seq é uma técnica que permite quantificar os níveis de expressão de uma forma muito mais precisa do que os métodos empregados anteriormente. Estudos que utilizaram esse método já alteraram a visão da extensão ... -
Bioinformática aplicada à unificação dos bancos de histocompatibilidade dos laboratórios de imunogenética do Hospital de Clínicas e Genética Molecular Humana da UFPR
(2012-04-09)Resumo: O Laboratório de Imunogenética do Hospital das Clínicas (LIHC) da Universidade Federal do Paraná (UFPR) dispõe de um grande volume de dados de tipagens HLA de familiares de pacientes, que foram cadastrados em um ... -
Banco de dados biológico no modelo relacional para mineração de dados em genomas completos de procariotos disponibilizados pelo NCBI GenBank
(2012-04-09)Resumo: O NCBI GenBank, um dos três principais bancos de dados primários, tem centralizado as informações obtidas pelos processos de sequenciamento de DNA e/ou RNA e as tem distribuído no formato de arquivos textos. Nos ... -
Biopen
(2012-04-09)Resumo: A presente pesquisa propõe o desenvolvimento da ferramenta computacional chamada BIOPEN, na área biológica para coletar, armazenar e gerar informações sobre características de Enteropatógenos bacterianos obtidas ... -
Montagem e anotação parcial da sequência genômica da Bactéria Diazotrófica Azospirillum Brasilense FP2
(2012-05-28)Resumo: Bactérias fixadoras de nitrogênio ou diazotróficas são organismos capazes de reduzir o dinitrogênio atmosférico em amônia, um processo chamado fixação biológica de nitrogênio que é catalisado pela enzima nitrogenase. ... -
Montagem do draft do genoma da bactéria Herbaspirillum Huttiense Subsp.Putei
(2012-09-11)Resumo: O gênero Herbaspirillum foi descrito em 1986 e hoje é composto por 11 espécies, dentre elas a bactéria Herbaspirillum huttiense subsp. putei, isolada no Japão a partir de amostras de água de poço. Neste projeto ... -
Montagem genômica da bactéria endofítica diazotrófica Herbaspirillum rubrisubalbicans M1
(2012-10-10)Resumo: Herbaspirillum rubrisubalbicans M1 é uma bactéria endofítica diazotrófica que causa a doença da estria mosqueada em algumas variedades suscetíveis de cana-deaçúcar. Nesse estudo, um total de 560.138 reads provenientes ... -
Montagem e análise preliminar do genoma de Bradyrhizobium elkanii 587 utilizando leituras de sequências de DNA curtas
(2012-10-10)Resumo: A fixação biológica de nitrogênio é um processo essencial para a vida na Terra e é realizada apenas por procariotos. Entre os fixadores de nitrogênio, as bactérias da ordem Rhizobiales são capazes de formar simbiose ... -
Mapeamento de genes nif publicados no NCBI usando conceitos de mineração de dados e inteligência artificial
(2012-10-10)Resumo: A Fixação Biológica de Nitrogênio é um importante processo biosustentável, aplicado na agricultura sob a forma de biofertilizantes. Na FBN ocorre a redução do dinitrigênio gasoso (N2) à amônia (NH4), mediante ... -
Utilização de técnicas de otimização de desempenho em bioinformática
(2012-12-12)Resumo: A área de bioinformática passou por um crescimento na quantidade de dados biológicos em formato digital devido ao desenvolvimento de novas tecnologias de sequenciamento de DNA e análise de expressão gênica. A base ... -
Wedring : pipeline para análise de expressão diferencial em experimento de RNA-Seq
(2013)Resumo: Transcriptoma e o conjunto completo de transcritos de uma célula em uma dada condição fisiológica e/ou de desenvolvimento. Atualmente, ha varias abordagens para se estudar o transcriptoma, tal como a tecnologia de ... -
Sistema computacional baseado em aprendizado de maquina para posicionamento taxonômico de bactérias utilizando dados fenotípicos
(2013)As bactérias são organismos unicelulares que apresentam ampla diversidade morfológica, metabólica e ecológica. Estes microrganismos pertencem ao Domínio Bactéria que, atualmente, conta com 52 Filos. A taxonomia bacteriana ... -
Bak4bio framework - Brasilian army knife for bioinformatics
(2013)Resumo:No desenvolvimento de software para a área de Bioinformática, pesquisadores consideram vários fatores para definir as tecnologias e metodologias utilizadas em um determinado projeto, não sendo raro encontrar soluções ...