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Mapeamento de genes nif publicados no NCBI usando conceitos de mineração de dados e inteligência artificial
(2012-10-10)Resumo: A Fixação Biológica de Nitrogênio é um importante processo biosustentável, aplicado na agricultura sob a forma de biofertilizantes. Na FBN ocorre a redução do dinitrigênio gasoso (N2) à amônia (NH4), mediante ... -
Metodologia computacional para estudo de genes com vizinhaça conectada : análise do cluster nif
(2015)Resumo: A atividade da nitrogenase é vital para a manutenção da vida terrestre e fonte de conhecimento para diversos campos científicos. Mineração de dados é uma técnica que quando bem executada possuí poder natural poder ... -
Metodologia de busca de similaridade de genes por matriz de co-ocorrência
(2013-05-16)Resumo: O barateamento das tecnologias de sequencimento de DNA têm resultado em um aumento expressivo de novos organismos sequenciados. No estudo destes dados cientistas utilizam o alinhamento de sequência de nucleotídeos ... -
Modelo computacional para comparação de táxons : filogenia global e mineração de dados na família Formicidae
(2021)Resumo: Formigas são consideradas "engenheiras do ecossistema" pois oferecem inúmeros serviços ecológicos e têm impacto na produção de sistemas agrícolas. A interação delas com o ambiente pode afetar desde a composição do ... -
Montagem e análise preliminar do genoma de Bradyrhizobium elkanii 587 utilizando leituras de sequências de DNA curtas
(2012-10-10)Resumo: A fixação biológica de nitrogênio é um processo essencial para a vida na Terra e é realizada apenas por procariotos. Entre os fixadores de nitrogênio, as bactérias da ordem Rhizobiales são capazes de formar simbiose ... -
Montagem e anotação do genoma da bactéria endofítica diazotrófica Herbaspirillum rubrisubalbicans M4
(2016)Resumo: Herbaspirillum rubrisubalbicans M4 é uma bactéria endofítica diazotrófica que provoca a doença da estria mosqueada em algumas variedades de cana-de-açúcar e sorgo. No presente estudo, um total de 4.101.514 reads ... -
Montagem e anotação parcial da sequência genômica da Bactéria Diazotrófica Azospirillum Brasilense FP2
(2012-05-28)Resumo: Bactérias fixadoras de nitrogênio ou diazotróficas são organismos capazes de reduzir o dinitrogênio atmosférico em amônia, um processo chamado fixação biológica de nitrogênio que é catalisado pela enzima nitrogenase. ... -
Montagem genômica da bactéria endofítica diazotrófica Herbaspirillum rubrisubalbicans M1
(2012-10-10)Resumo: Herbaspirillum rubrisubalbicans M1 é uma bactéria endofítica diazotrófica que causa a doença da estria mosqueada em algumas variedades suscetíveis de cana-deaçúcar. Nesse estudo, um total de 560.138 reads provenientes ... -
Montagem, anotação e comparação do genoma parcial da bactéria Azoarcus olearius DQS4
(2015)Resumo: Existem na natureza bactérias capazes de transformar o nitrogênio existente no ar em amônia, um processo denominado Fixação Biológica de Nitrogênio (FBN), e transferi-lá para plantas nessa forma a qual consigam ... -
Neuritescan : um pacote R para análise de neuritos
(2021)Resumo: Para compreender doenças neurológicas é imprescindível analisar a morfologia e as funções dos neurônios. As funções neuronais são diretamente ligadas às conexões entre os neurônios. Estas conexões ocorrem nos ... -
Oroboro : modelo para descrição temporal do átomo de hidrogênio através da feature resonance neural network
(2020)Resumo: Com importância ampla e inquestionável, o estudo da modelagem e dinâmica moleculares necessita constantemente de avanços e o desenvolvimento de novas técnicas é bem-vindo. O aprendizado de máquina vem sendo ... -
Perfis de atividade de regulon : inferência e aplicações
(2019)Resumo: O entendimento do câncer é um dos desafios cruciais da ciência atual. Em busca desta compreensão, governos e institutos em todo o mundo estão gerando uma abundância de dados biológicos. Dentre os tipos de dados, ... -
PreProcSEQ : pipeline de controle de qualidade e pré-processamento de dados de RNA-Seq
(2022)Resumo: O sequenciamento de RNA através de sequenciadores de nova geração é denominado de RNA-Se , este sequenciamento permite estimar a abundância de transcritos e a identificação de genes diferencialmente expressos entre ... -
Procura in sílico por genes de tripanosomatídeos com possível função regulatória do sistema complemento humano
(2014)Resumo: O Trypanosoma cruzi e o agente causador da doença de Chagas e possui um ciclo de vida complexo que alterna entre hospedeiros invertebrados e vertebrados. O ciclo do T. cruzi no hospedeiro vertebrado inicia-se na ... -
Quando há muito o que ser dito : utilização de técnicas de inteligência artificial e análise de sentimentos para classificação de textos relacionados ao suicídio
(2022)Resumo: Segundo dados da Organização Mundial da Saúde, anualmente, mais de 700 mil pessoas morrem por suicídio no mundo. Nesse contexto, buscou-se no presente artigo utilizar-se das técnicas de inteligência artificial e ... -
Re-anotação do genoma de Herbaspirillum seropedicae SmR1 com dados de transcriptoma por RNA_Seq
(2014)Resumo: As plantas necessitam do Nitrogênio para sintetizar várias moléculas que são essenciais para sua sobrevivência, porém, não conseguem fixá-lo a partir do ar atmosférico. É neste contexto que entram em cena as bactérias ... -
Reder Gallery : um portal para publicações de estudos de caso
(2018)Resumo: Redes complexas se tornaram uma importante ferramenta no que se refere à análise e observação de uma grande quantidade de dados e como eles interagem entre si. Por vezes, essa mesma grande quantidade de dados acaba ...