Navegação Dissertações por título
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Desenvolvimento da ferramenta para finalização de montagens de genomas in silico - FGAP
(2014)Resumo: A finalização é a etapa que consome mais tempo e demanda maior esforço em projetos de determinação de sequências genômicas. Diversos métodos computacionais (in silico) foram propostos com o objetivo de resolver ... -
Desenvolvimento de ferramenta computacional para identificação de promotores Sigma 54 utilizando rede neural artificial
(2012)Resumo: A transcrição de vários genes bacterianos é regulada por fatores sigma alternativos da RNA polimerase como o sigma 54 ou sigma N. A sequência consenso (mrNrYTGGCACG-N4-TTGCWNNw) do fator sigma 54 esta localizada ... -
Desenvolvimento de ProClaT, uma ferramenta computacional para a classificação de proteínas : o caso "DraB" de Azospirillum brasiliense
(2010)Resumo: Azopirillum brasilense é uma bactéria fixadora de nitrogênio que promove o crescimento vegetal e é utilizada como bio-fertilizante na agricultura. Uma vez que o processo demanda um alto gasto de energia, a redução ... -
Desenvolvimento e validação de sistema de apoio à decisão em urinálise com inteligência artificial utilizando redes neuronais
(2011)Resumo: A urinálise contempla uma avaliação semi-quantitativa de analitos e contagem diferencial de células presentes na urina. A análise fornece informações diagnósticas relevantes principalmente sobre o sistema urinário ... -
Estudo da aplicação de redes neuronais artificiais para apoio à decisão na liberação do perfil lipídico e de glicemia em jejum.
(2011)Resumo: As determinações do perfil lipídico (colesterol total, HDL-colesterol, LDL-colesterol, triglicérides) e da glicemia em jejum são ensaios de grande demanda nos laboratórios clínicos. A liberação destes resultados ... -
Identificação de homólogos e análise de vizinhança dos genes draTG envolvidos na regulação da fixação biológica de nitrogênio
(2015)Resumo: Nitrogenase é a enzima responsável pelo processo de Fixação Biológica de Nitrogênio (FBN), no qual o gás dinitrogênio é reduzido para amônia por microorganismos. Em algumas bactérias fixadoras de nitrogênio, como ... -
Identificação de Splicing alternativo em sítios de início de transcrição de mRNAS de arroz utilizando dados de RNA-Seq.
(2012)Resumo: RNA-Seq é uma técnica que permite quantificar os níveis de expressão de uma forma muito mais precisa do que os métodos empregados anteriormente. Estudos que utilizaram esse método já alteraram a visão da extensão ... -
Identificação de variantes de splicing alternativo de RNAs não codificadores no transcriptoma de carcinoma cervical de células escamosas e adenocarcinoma cervical
(2019)Resumo: A porção inicial do útero que realiza a comunicação com o canal vaginal é chamada de cérvice uterina. Nessa região pode-se desenvolver o câncer cervical, também conhecido popularmente como câncer de colo de útero. ... -
Identificação e análise de promotores Sigma 70 no genoma de Herbaspirillum seropedicae SmR1 utilizando métodos de inteligência artificial
(2014)Resumo:Sigma 70 ou sigma N constituem fatores complementares da RNA-polimerase, cuja principal função é promover a transcrição de genes procarióticos. No caso de Escherichia coli, o consenso da região -35 (TTGACA) e -10 ... -
Identificação e avaliação de padrões repetitivos no proteoma de Trypanosoma Cruzi
(2019)Resumo: Regiões repetidas são primordiais para a sobrevivência de Trypanossoma cruzi, pois tem sido atribuído a elas um papel importante no processo de evasão do sistema imune de hospedeiros mamíferos. A compreensão de ... -
Identificação in silico de sítios de ligação à proteína regulatória NTRC em sequências genômicas
(2019)Resumo: O nitrogênio é um elemento essencial para a manutenção da vida na Terra. Apesar disso sua maior concentração está presente na atmosfera. Algumas proteobactérias possuem o sistema Ntr, que é responsável pelo processo ... -
JMSA : Java Mass Spectrometry Analyzer: ferramenta para gerenciamento e análise de banco de espectros de massa para identificação de microrganismos
(2017)Resumo: A utilização da espectrometria de massa MALDI-TOF permite a identificação de microrganismos através da geração de espectros de massa, representando um perfil característico de sinais obtidos a partir de peptídeos ... -
Mapeamento de genes nif publicados no NCBI usando conceitos de mineração de dados e inteligência artificial
(2012-10-10)Resumo: A Fixação Biológica de Nitrogênio é um importante processo biosustentável, aplicado na agricultura sob a forma de biofertilizantes. Na FBN ocorre a redução do dinitrigênio gasoso (N2) à amônia (NH4), mediante ... -
Metodologia computacional para estudo de genes com vizinhaça conectada : análise do cluster nif
(2015)Resumo: A atividade da nitrogenase é vital para a manutenção da vida terrestre e fonte de conhecimento para diversos campos científicos. Mineração de dados é uma técnica que quando bem executada possuí poder natural poder ... -
Metodologia de busca de similaridade de genes por matriz de co-ocorrência
(2013-05-16)Resumo: O barateamento das tecnologias de sequencimento de DNA têm resultado em um aumento expressivo de novos organismos sequenciados. No estudo destes dados cientistas utilizam o alinhamento de sequência de nucleotídeos ... -
Modelo computacional para comparação de táxons : filogenia global e mineração de dados na família Formicidae
(2021)Resumo: Formigas são consideradas "engenheiras do ecossistema" pois oferecem inúmeros serviços ecológicos e têm impacto na produção de sistemas agrícolas. A interação delas com o ambiente pode afetar desde a composição do ... -
Montagem e análise preliminar do genoma de Bradyrhizobium elkanii 587 utilizando leituras de sequências de DNA curtas
(2012-10-10)Resumo: A fixação biológica de nitrogênio é um processo essencial para a vida na Terra e é realizada apenas por procariotos. Entre os fixadores de nitrogênio, as bactérias da ordem Rhizobiales são capazes de formar simbiose ... -
Montagem e anotação do genoma da bactéria endofítica diazotrófica Herbaspirillum rubrisubalbicans M4
(2016)Resumo: Herbaspirillum rubrisubalbicans M4 é uma bactéria endofítica diazotrófica que provoca a doença da estria mosqueada em algumas variedades de cana-de-açúcar e sorgo. No presente estudo, um total de 4.101.514 reads ...