• Login
    View Item 
    •   DSpace Home
    • BIBLIOTECA DIGITAL: Teses & Dissertações
    • 40001016066P4 Programa de Pós-Graduação em Bioinformática
    • Dissertações
    • View Item
    •   DSpace Home
    • BIBLIOTECA DIGITAL: Teses & Dissertações
    • 40001016066P4 Programa de Pós-Graduação em Bioinformática
    • Dissertações
    • View Item
    JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

    Montagem e anotação parcial da sequência genômica da Bactéria Diazotrófica Azospirillum Brasilense FP2

    Thumbnail
    View/Open
    R - D - SILVEIRA, LEVISTON DA.pdf (3.273Mb)
    Date
    2012-05-28
    Author
    Silveira, Leviston da
    Metadata
    Show full item record
    Subject
    Teses
    xmlui.dri2xhtml.METS-1.0.item-type
    Dissertação
    Abstract
    Resumo: Bactérias fixadoras de nitrogênio ou diazotróficas são organismos capazes de reduzir o dinitrogênio atmosférico em amônia, um processo chamado fixação biológica de nitrogênio que é catalisado pela enzima nitrogenase. Azospirillum brasilense é uma bactéria fixadora capaz de se associar a raízes de gramíneas como trigo e arroz, e promover o crescimento do vegetal e aumento de produtividade. Neste trabalho utilizamos 5.768.466 milhões de seqüência de nucleotídeos obtidas em seqüenciador Solexa/Illumina e 112.782.028 milhões de seqüências de nucleotídeos obtidas em seqüenciador SOLID que foram utilizadas para obter uma seqüência parcial do genoma da espécie Azospirillum brasilense estirpe FP2. Para a montagem foi utilizado o montador Velvet para os dados Solexa e um pacote de programas adaptados para a montagem SOLID. Para finalização e correção da montagem, as montagens parciais de cada um dos métodos de seqüenciamentos foram mescladas, resultando em preenchimento de falhas. Como resultado final obtivemos uma sequência com 6.931.925 pb (386 scaffolds e 57 contigs) com aproximadamente 103.630 pb não determinadas. A sequência foi ordenada e alinhada ao genoma de A. brasilense estirpe Sp245 que foi utilizada como sequência de referência. A anotação parcial da sequência permitiu identificar 6119 genes, entre estes os envolvidos no metabolismo do nitrogênio.
    URI
    http://hdl.handle.net/1884/27417
    Collections
    • Dissertações [63]

    DSpace software copyright © 2002-2016  DuraSpace
    Contact Us | Send Feedback
    Theme by 
    Atmire NV
     

     

    Browse

    All of DSpaceCommunities & CollectionsBy Issue DateAuthorsTitlesSubjectsxmlui.ArtifactBrowser.Navigation.browse_typeThis CollectionBy Issue DateAuthorsTitlesSubjectsxmlui.ArtifactBrowser.Navigation.browse_type

    My Account

    LoginRegister

    Statistics

    View Usage Statistics

    DSpace software copyright © 2002-2016  DuraSpace
    Contact Us | Send Feedback
    Theme by 
    Atmire NV